Basic Information

Symbol
NDUFB5
RNA class
mRNA
Alias
NADH:Ubiquinone Oxidoreductase Subunit B5 CI-SGDH SGDH NADH Dehydrogenase [Ubiquinone] 1 Beta Subcomplex Subunit 5, Mitochondrial NADH Dehydrogenase (Ubiquinone) 1 Beta Subcomplex, 5, 16kDa NADH-Ubiquinone Oxidoreductase SGDH Subunit Complex I SGDH Subunit Complex I-SGDH MGC12314 NADH Dehydrogenase (Ubiquinone) 1 Beta Subcomplex, 5 (16kD, SGDH) CISGDH
Location (GRCh38)
3:179604690-179627647
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002492.4
Sequence length
4199.0 nt
GC content
0.3977

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1104.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1185.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1134.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199957.2 NCBI
CUUCCUCCUGCCCGUAGUAGCCAUGGCGGCCAUGAGUUUGUUGCGGCGG… 4043 nt 0.3980
NM_001199958.2 NCBI
CUUCCUCCUGCCCGUAGUAGCCAUGGCGGCCAUGAGUUUGUUGCGGCGG… 4092 nt 0.3978
NM_002492.4 NCBI
CUUCCUCCUGCCCGUAGUAGCCAUGGCGGCCAUGAGUUUGUUGCGGCGG… 4199 nt 0.3977
Summary

The protein encoded by this gene is a subunit of the multisubunit NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I). Mammalian complex I is composed of 45 different subunits. It locates at the mitochondrial inner membrane. This protein has NADH dehydrogenase activity and oxidoreductase activity. It transfers electrons from NADH to the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme is believed to be ubiquinone. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the NDUFB5 is stabilized by METTL3 and IGF2BP2 m6A modification, reversing AGE-induced inhibition of endothelial cell function and accelerating diabetic wound healing [Zhang et al. DOI:10.7150/ijbs.114988]. In a separate investigation in rats, the NDUFB5 was identified as a metabolism gene involved in mitochondrial electron transport and exhibited significantly altered expression on day 4 following a 20% total body surface area burn injury [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].