Basic Information

Symbol
ARHGAP35
RNA class
mRNA
Alias
Rho GTPase Activating Protein 35 GRF-1 P190A P190ARhoGAP P190RhoGAP KIAA1722 GRLF1 Glucocorticoid Receptor DNA-Binding Factor 1 Glucocorticoid Receptor Repression Factor 1 Rho GTPase-Activating Protein 35 Rho GAP P190A P190-A Glucocorticoid Receptor DNA Binding Factor 1 P190ARHOGAP GRF1
Location (GRCh38)
19:46860997-47005077
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004491.5
Sequence length
9290.0 nt
GC content
0.5277

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3422.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3580.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2436.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004491.5 NCBI
GCCCCGAGGGAGAGCCGCGGCGCGGCGGCAGGAGGAGGUGGAGGAGGCG… 9290 nt 0.5277
Summary

The human glucocorticoid receptor DNA binding factor, which associates with the promoter region of the glucocorticoid receptor gene (hGR gene), is a repressor of glucocorticoid receptor transcription. The amino acid sequence deduced from the cDNA sequences show the presence of three sequence motifs characteristic of a zinc finger and one motif suggestive of a leucine zipper in which 1 cysteine is found instead of all leucines. The GRLF1 enhances the homologous down-regulation of wild-type hGR gene expression. Biochemical analysis suggests that GRLF1 interaction is sequence specific and that transcriptional efficacy of GRLF1 is regulated through its interaction with specific sequence motif. The level of expression is regulated by glucocorticoids. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for ARHGAP35 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ARHGAP35 gene was down-regulated across all seven brain regions examined in ethanol-naïve High Drinking in the Dark (HDID-1) mice compared to control mice, with fold changes ranging from -1.45 to -1.85 [Ferguson et al. DOI:10.1007/S12035-018-1252-0].