Basic Information

Symbol
NECAB2
RNA class
mRNA
Alias
N-Terminal EF-Hand Calcium Binding Protein 2 EFCBP2 N-Terminal EF-Hand Calcium-Binding Protein 2 Synaptotagmin-Interacting Protein 2 Neuronal Calcium-Binding Protein 2 EF-Hand Calcium-Binding Protein 2 Stip-2 EF-Hand Calcium Binding Protein 2 Neuronal Calcium Binding 2
Location (GRCh38)
16:83968244-84002776
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_019065.3
Sequence length
1996.0 nt
GC content
0.6543

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-941.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -974.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001329748.1 NCBI
GCGGCGGGCGCGGCGCGAUGUGCGAGCGGGCGGCGCGCCUGUGCAGGGC… 1552 nt 0.6128
NM_001329749.2 NCBI
GAUGUGCGAGCGGGCGGCGCGCCUGUGCAGGGCCGGCGCGCACAGGCUG… 1566 nt 0.6079
NM_019065.3 NCBI
CUCUGCUGCGCGCCGCGAGUGGGAGGGGGGACUUUAGAAGCGGGGAGAG… 1996 nt 0.6543
Summary

The protein encoded by this gene is a neuronal calcium-binding protein that binds to and modulates the function of at least two receptors, adenosine A(2A) receptor and metabotropic glutamate receptor type 5. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

A study in humans identified the NECAB2 as a differentially expressed gene among the top 10 by P-value when comparing acute myocardial infarction (AMI) patient blood samples at 1 day versus 7 days and at 1 day versus 3 months post-event [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3]. A study in mice demonstrated that the mRNA expression of the NECAB2 was selected from a microarray analysis of heart tissue following methamphetamine administration and restraint, but quantitative RT-PCR validation did not show a statistically significant change in its expression [Shinone et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2010.01.001].