Basic Information

Symbol
ARHGAP40
RNA class
mRNA
Alias
Rho GTPase Activating Protein 40 DJ1100H13.4 C20orf95 Rho-Type GTPase-Activating Protein 40 Rho GTPase-Activating Protein 40 Chromosome 20 Open Reading Frame 95
Location (GRCh38)
20:38601775-38651035
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164431.3
Sequence length
2967.0 nt
GC content
0.5757

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1184.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1233.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 779.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164431.3 NCBI
AGUCCUGCAUGAGGGUGUCUGGGAACUGGGUGCGCCACGGGGGCCCUAC… 2967 nt 0.5757
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Predicted to be involved in regulation of actin filament polymerization and regulation of small GTPase mediated signal transduction. Predicted to be located in cytosol. Predicted to be active in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the ARHGAP40 as a differentially expressed gene downregulated in left ventricular tissue from animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].