Basic Information

Symbol
NECTIN3
RNA class
mRNA
Alias
Nectin Cell Adhesion Molecule 3 Nectin-3 CDw113 PVRR3 CD113 PVRL3 PPR3 Poliovirus Receptor-Related Protein 3 Poliovirus Receptor-Related 3 DKFZP566B0846 PRR3 CD113 Antigen Nectin 3
Location (GRCh38)
3:111070071-111275563
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015480.3
Sequence length
5197.0 nt
GC content
0.3527

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1299.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1406.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1326.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001243286.2 NCBI
AGCCUCGGCAGUGGCGUCGGCGACGGCGGUGUCGAGGCAGCCGCCAGCG… 5171 nt 0.3520
NM_001243288.2 NCBI
AGCCUCGGCAGUGGCGUCGGCGACGGCGGUGUCGAGGCAGCCGCCAGCG… 2859 nt 0.4813
NM_015480.3 NCBI
AGCCUCGGCAGUGGCGUCGGCGACGGCGGUGUCGAGGCAGCCGCCAGCG… 5197 nt 0.3527
Summary

This gene encodes a member of the nectin family of proteins, which function as adhesion molecules at adherens junctions. This family member interacts with other nectin-like proteins and with afadin, a filamentous actin-binding protein involved in the regulation of directional motility, cell proliferation and survival. This gene plays a role in ocular development involving the ciliary body. Mutations in this gene are believed to result in congenital ocular defects. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in humans identified the NECTIN3 as a potential myocardial infarction biomarker mentioned in the introduction and discussion of the literature [Zhao et al. DOI:10.3892/etm.2017.5580]. A study in rats demonstrated that the NECTIN3 was one of 14 wound healing-related mRNA markers selected via stepwise Fisher Discriminant Analysis to construct a multivariate statistical model for estimating wound age in skeletal muscle contusions [Du et al. DOI:10.1007/s00414-018-01990-2].