Basic Information

Symbol
NEDD4L
RNA class
mRNA
Alias
NEDD4 Like E3 Ubiquitin Protein Ligase KIAA0439 NEDD4-2 RSP5 Neural Precursor Cell Expressed, Developmentally Down-Regulated 4-Like, E3 Ubiquitin Protein Ligase HECT-Type E3 Ubiquitin Transferase NED4L E3 Ubiquitin-Protein Ligase NEDD4-Like NEDD4.2 Neural Precursor Cell Expressed, Developmentally Down-Regulated 4-Like Ubiquitin-Protein Ligase Rsp5 EC 2.3.2.26 EC 2.3.2.36 HNEDD4-2 EC 6.3.2 Nedd4-2 PVNH7 NEDL3
Location (GRCh38)
18:58044050-58401540
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001144967.3
Sequence length
8633.0 nt
GC content
0.4559

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2664.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2820.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2189.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001144964.1 NCBI
AUUUUGACCGCUAUUUAGAAGAGUGACCUCAUAAAUCUUUUAGCAAAGU… 8436 nt 0.4352
NM_001144965.2 NCBI
AGUCACAGAGGAAGCCAUUUCCAGAGAGGAACAACCGUGUAGACUGCUU… 8400 nt 0.4368
NM_001144966.3 NCBI
AGUUGUGUUAAAACUUGCUGGUAUUCCCCCGGUAUCAGCAGAGGUGUGU… 8263 nt 0.4374
NM_001144967.3 NCBI
GAGAGCGGGGGCCCGGACGGCGCUAGCGAGGAGGCGGGCGAGCCGGGUC… 8633 nt 0.4559
NM_001144968.2 NCBI
AGUCACAGAGGAAGCCAUUUCCAGAGAGGAACAACCGUGUAGACUGCUU… 8390 nt 0.4367
NM_001144969.2 NCBI
AGUCACAGAGGAAGCCAUUUCCAGAGAGGAACAACCGUGUAGACUGCUU… 8330 nt 0.4353
NM_001144970.3 NCBI
ACAUUUGAAUUUGCUCCCGAUUCGAGAGAGGCAGGCAUCCGCGGCAGCA… 8345 nt 0.4424
NM_001144971.2 NCBI
AGUCACAGAGGAAGCCAUUUCCAGAGAGGAACAACCGUGUAGACUGCUU… 8418 nt 0.4348
NM_001243960.2 NCBI
GAGAGCGGGGGCCCGGACGGCGCUAGCGAGGAGGCGGGCGAGCCGGGUC… 8441 nt 0.4541
NM_015277.6 NCBI
GAGAGCGGGGGCCCGGACGGCGCUAGCGAGGAGGCGGGCGAGCCGGGUC… 8573 nt 0.4547
Summary

This gene encodes a member of the Nedd4 family of HECT domain E3 ubiquitin ligases. HECT domain E3 ubiquitin ligases transfer ubiquitin from E2 ubiquitin-conjugating enzymes to protein substrates, thus targeting specific proteins for lysosomal degradation. The encoded protein mediates the ubiquitination of multiple target substrates and plays a critical role in epithelial sodium transport by regulating the cell surface expression of the epithelial sodium channel, ENaC. Single nucleotide polymorphisms in this gene may be associated with essential hypertension. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

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