Basic Information

Symbol
NEFM
RNA class
mRNA
Alias
Neurofilament Medium Chain NF-M NFM NEF3 Neurofilament, Medium Polypeptide 150kDa Neurofilament Medium Polypeptide Neurofilament Triplet M Protein 160 KDa Neurofilament Protein Neurofilament 3 Neurofilament, Medium Polypeptide Neurofilament-3 (150 KD Medium) Neurofilament Medium
Location (GRCh38)
8:24913758-24919098
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005382.2
Sequence length
3271.0 nt
GC content
0.5283

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-997.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1057.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 984.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.....(((.((((......(((((..((.....))..)))))...(((((((.(((((.(((.....))))))))........((.((((..(((((.(((((....)))))(((((((..(((((...)))))((.(((((((....)))))))))(((.(((((.((((((((((((....((.(..(...(((..(((((..(((.(((....(((.((...((((((((((...(.((((..((((((((((.(((..(((((((((((((.....(((.(((((......(((((.(((........))))))))..........))))).))))))))))).........((((((((..((((...((....(.((((...(((......)))....((((((((..(((.....(((((((.((((.......))))))))(((.(((((....)))))..)))...(((((((((((((((.((((((((.....(((.....(((....))).....))).....)))))))).)...))).....((((.(((.....))).))))(((((((....))))))).((((((((.((((((....((.((..(((((.((((((((((((((((((.....(.((..(..(((.(((((......))))).)))...)..)).))))))).))).)).))))..))).)))))..))))..)))))).)....((((((((((.....(((((((.....((((((((((.(((......))).(((((...((....(((....))).....))....)))))...((....)).(((((.(((((..((((((((.(.((.............)).)...)))))))).....((((((.((..........)).))))))))))).).....))))((((((.(((((.((..((.((.....((((.((((((((.(.((((...((......))....)))).).)))))))).)))).(((.((....))))).(.(((.((((..((....))..))))))).)..((((..(((((.......((....(((..(((((...))))).....((((((((..(((...)))((...(((.((((.......))))...)))...))(((((..(.(((...((((((((.............((((.(((......(((((....(((...(.(.((.((((((((.....(((.....)))((.((((.(..((.....(...((...((((..((................(((...(((...(((((.(((((....)))))...((((..(((...(((.((...(....)...)).)))......)))..))))......((....(((((((.((((.......((........))....)))).)))))))....)).((((........(((((.........((........))....(((...........))).))))).......))))((((.......)))))))))...)))...)))...)).))))....)).).....))..).)))))).........................)))))))))).))..))).....)))))..(((.....)))...((((........))))....))).)))).............))).)))))....))).)..)))))..))))))))...............)))..)).......)))))..)))))).))..)).))))).)))))).))))))....))))...)))))))...))))..)))))).((((....((.(((.(((..((....((((((....)).))))....)).))).)))..))....)))).))))))).((((....((.(((.(((..((....((((((....)).))))....)).))).)))..))....)))).)))))))).)))............))).......))).)))))))))))))....))....))))....)))))))).............)))))..)))........................))))))))))..)))))...)))......((((.(......((........))......).)))).............)))))))(((((....))).))..((.(((((..(((((..((((...(((.....)))...)))))))))...........((........))....))))).)).))..)))......))))))...)))))..)))...)..)..))....))))..)))).))))..)))))...))).(((.....))).((((....)))).)))))))................))))).)))).))....((((.....((((..(((..((.((..(........).)).)).)))...))))...)))).)))))))............)))).))).....(((((((....((...((((((.......(((((.....(((.((........))..)))....))))).......))))))...))....)).)))))...((.(((((..(((((((.(((((((((..((((..(((....((((((.....))))))...)))..))))..........((((.(((((((((.....))))))..........))).)))).)))))))..((((.((.(((.............))).)))))).............((((((((((((((((.((.((((..(.(((((((........))))))).)..)))).)).)))....((((((((((((.(((((.........))))).......((((((((((..........(((((((((....))))))))).(((.((....)).)))..(((((((.......)))))))..)))))))))).))))))..))))))............................(((.........)))..((((((....)))))).((((.....))))........((((((....))))))))))))))).))))....((((.....)))).)))))))))..))))).))....)))))))).(..(((........)))..)..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.,{{.(((.((((....,,((({{..((.....}},.||||}{{{(((((((.{(((,{(({.{,,,||||||||.......,||}|||{...{{{{,(((((....)))))|((((((.{((({{{{{||}||{{.(((((((....})))))}}}(((.(((((.((((((((((((....{(.{..(...(((.,((((({((((,(((,({((({,{{,.,{(((((((((.,,,.((((..((((((((((.,({..(((((((((((((,,...(((.(((((,{,.,{(((((,(((........)))}}|||{{........))))).))))}})))})|{.....{{((((((((..(({(...{{...{({({,,...(((..,,..)))....{((({{((..{(({|...{||((((.((((.......)))))))}(((.(((((....)))))..)))...,,((((({(,(((((.((((((((.,,,.(((.....(((....)))}.,,.})),,...)))))))).)...)))}.,.}||||.(((.....))).))))((({{{{.,,,))))))).|||,{((({(((((({{,.{{.{,..({{{|,|{{,{|||||||||||||.....,.{|,,|,.|||}|||||,.}}..)))))|)))||.}..,..{|||||,.,,|{|,.|,,|{,|||{||,||{,||}|{{||,,||.,..||((({,,((((,....{{{||{{|,,..|||.||((((,{,{.....,))).(((((...((....(((....)))...,,)}....)))))...((....))||||||,|{,,}},.|||||||}..||}}....}}}}}}.(((,....((((((......)))))).})))..((({,,{,.||}||||}}}}.......}}}}})}.|||}||||,}}..}|,.,....,((((.{{{{||||,{,{((({{,{{,,..,.||,,,.}})).}.)))))))).)))).(({.,,.{{{|{|||{({(((.((((..((....))..)))))))...........,(((((.(((....(({.....}}}})}.))))).......)))}}}}}},}}....}}|({..((((((.(({(({.{.,...........(((((((..,(((,.,.|}}}((((..,.{||...,..}}),}}.}}},....(((((.((((((..((,......}))..))).))).)))))....{(.(((({((.{{.....,.{.((...((((..{{.,....,,...,..,,|{{...,{(...{{{{(,{((((....}})}|...((((..(((...(((.((...,....}...)).))}......)))..)))).....,||....(((((((.((((.......((........))....)))).)))))))....},.((((........(((((.........((........,)}...,((...........,,,.))))).......))))((((.......))))}}}))...}}}...,,...,},.))))....)).}.....}}..))))))}}....)))))))....,))))}.,}))))}..))...|{...((.....})}.}}.(((.....)))...((((........))))...|||||,,..{{...{{{{{,..,...,{{|..,|||..,((,{,,,.,{||,.}}||...............,,},.........,}.,}}..,))||}.||.,{,,||||}|||||||.,,,)))..|||}}....)))},,,...))))..}))))).((((....((.(((.(((..((....((((((....)).))))....)).))).)))..))....)))}.,)))))).((((....((.(((.(((..((....((((((....)).))))....)).))).)))..))....))))..)))))),.,))....}}}}}..,}},.......})).}}))))))}}}}}....||.,..}})}....))))}})},.....|,...,))},,,..))}...,.....}}}},..........))))))))))..))))},..)).......((((.(......((........))......).))))............,))))))|(((((....))).))},}}}})))).}}||||{{({((.|.(((.....)))...)))),,}||||.........}},.......||{....)).)}}}.}),),..........,,,,...)))))..)}).,.)..,..)),.,.)))}.,)))).)))}..)))))...))).,{{..,..))),|{{,..,,))}}.))))))}},,.,..},......,)}))).)}}).)),,.}|||,,....||||,.|||},}},....|}.....||||||{}|.|}|,}.}|||...|||,.||||}}}............)}}),))}.....,||.,,|.....,|{|||,{,|||.....}}}.....{{((((((((((((({{,.{{.(((((((..{,{(((((((.,...,{{{.,..||.||.{{{,,{{((((,.............}}|}|}}}}|{{{..{{{....((((((.....))))))...}))..))}}.....{{...,,...||.{(((((.....)))))}.....{(((((...(((((...((({...|((((({((({..,.(((((((({(({.((((.((((((.......,,.(((,,,,}}}.,,)))))))))},))}}))))))}...}))),)}})})}.},,)})).,.))}}}}}}}}|((((((((((((.(((,..{(((((((({,,.{(((({,....,,)))}},..,((,,......}}))))))))))))))..)),,))))).)))}|,,||,,,,,}.}}}}},)))))))).})...))))))}.|||||},........................,}}|||,|,......}}},.{{{{{{....,}}))),},))))))))))).)))}...((((((....))))))||,..||}){|{(((((((({{..,..}})}..,..,)))))).}}},}}}...,)))))))).,..{{{.,,|,,,.,}}..}.},,}},.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105541.2 NCBI
AGAGCACGCGCGCCGCAGACCUAGGGUAUUUGCGGAUCAGCGUCCUCGC… 2469 nt 0.4739
NM_005382.2 NCBI
GCUGUGACAGCCACACGCCCCAAGGCCUCCAAGAUGAGCUACACGUUGG… 3271 nt 0.5283
Summary

Neurofilaments are type IV intermediate filament heteropolymers composed of light, medium, and heavy chains. Neurofilaments comprise the axoskeleton and functionally maintain neuronal caliber. They may also play a role in intracellular transport to axons and dendrites. This gene encodes the medium neurofilament protein. This protein is commonly used as a biomarker of neuronal damage. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.