Basic Information

Symbol
NEK11
RNA class
mRNA
Alias
NIMA Related Kinase 11 NIMA (Never In Mitosis Gene A)- Related Kinase 11 Serine/Threonine-Protein Kinase Nek11 FLJ23495 Never In Mitosis A-Related Kinase 11 NimA-Related Protein Kinase 11 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11
Location (GRCh38)
3:131026850-131353043
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024800.5
Sequence length
2926.0 nt
GC content
0.4371

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-844.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -900.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 797.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001146003.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 2756 nt 0.4361
NM_001321220.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 2853 nt 0.4385
NM_001321221.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 3052 nt 0.4368
NM_001321222.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 2538 nt 0.4460
NM_001321223.1 NCBI
UGGAUGACCUAAAAGUGGACUGGGAUGGGGGUGGCAGGGCUGAGUCUGU… 1855 nt 0.4183
NM_001321224.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 2579 nt 0.4378
NM_001353022.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 3264 nt 0.4427
NM_001353023.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 3138 nt 0.4433
NM_001353024.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 3119 nt 0.4444
NM_001353025.2 NCBI
ACGGUUCCAAACAGCCGUGGCCCGCGGUGUCUGGCGCUCGGUGGGUGUG… 2850 nt 0.4382
Showing 1 to 10 of 33 entries
Summary

This gene encodes a member of the never in mitosis gene A family of kinases. The encoded protein localizes to the nucleoli, and may function with NEK2A in the S-phase checkpoint. The encoded protein appears to play roles in DNA replication and response to genotoxic stress. Alternatively spliced transcript variants have been described.[provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem tissue RNA sequencing demonstrated that the NEK11 gene was downregulated in the lungs as part of the inhibited cell cycle pathway in patients who succumbed to septic shock [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].