Basic Information

Symbol
ARHGAP45
RNA class
mRNA
Alias
Rho GTPase Activating Protein 45 KIAA0223 HMHA1 HA-1 Rho GTPase-Activating Protein 45 Histocompatibility (Minor) HA-1 Minor Histocompatibility Antigen HA-1 Minor Histocompatibility Protein HA-1 HLA-HA1
Location (GRCh38)
19:1065923-1086642
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012292.5
Sequence length
4272.0 nt
GC content
0.6585

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2009.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2073.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1218.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258328.4 NCBI
AGGGCCGGGCCAGAAGCCCAUCCGACAUCCAGCUGACCCUCACCCUCUG… 4148 nt 0.6533
NM_001282334.2 NCBI
AGCUGGAAUCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAUGCAAUCU… 3309 nt 0.6461
NM_001282335.3 NCBI
GGUUUGGCCACCGGAGACCCCCAUCGGUCAGCUGCCAGGCCCCACGCGC… 3761 nt 0.6533
NM_001321232.2 NCBI
GAGUGGAGCCCGGGUGAGACCCGGAGCUGACGCCGGGCCGCAGGGGGAC… 4120 nt 0.6580
NM_012292.5 NCBI
ACUCCGCAGAGCCGCAGGCUGAGGCCGGGAAGGGUCGGGGGCGAGGCCG… 4272 nt 0.6585
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Predicted to be involved in negative regulation of small GTPase mediated signal transduction. Located in cytosol and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that acute alcohol exposure during neurulation induces significant short-term transcriptomic changes in the rostroventral neural tube, with ARHGAP45 ARHGAP45 being differentially expressed at both 2 and 4 hours post-exposure [Boschen et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2022.09.001].