Basic Information

Symbol
NELL2
RNA class
mRNA
Alias
Neural EGFL Like 2 NRP2 Protein Kinase C-Binding Protein NELL2 NEL-Like Protein 2 Neural Epidermal Growth Factor-Like 2 NEL-Related Protein 2 Nel-Related Protein 2 Nel (Chicken)-Like 2 NEL-Like 2 (Chicken)
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Chronological age estimation Sudden cardiac death diagnosis

MANE select

Transcript ID
NM_001145108.2
Sequence length
3553.0 nt
GC content
0.4571

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1091.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1161.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1031.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.(((........((((((((.((.(((...((.((((((((.((((..((((((.((.(((.((((.((((((..((.(((......(((((((.((.((((...))))))...)))))))...))).)).....)))))).))))))).)).))))))..)))))))))))).))....)))))))))))))..(((((.(((((((..(((...((((((.....((((((.((((...(((((((..............(((((....))))).......)))))))..)))).))))))...))))))....))).....))))))).))))))))))))))))...((((((.....((((....))))..((((((.((...............)).))))))(((((.((((...((.....))....))))...))))).((((((...(((((((((((.((((((.....((((((..(((((((.((((((((((((((((...((((((....(((((.(((....))))))))....)))))))))))))...........))))))))).)))))))....))))))(((((.......))))).(((..((((((((.(((....(((((((((((....(((..(((((.((((((((...))))))))......((((((((((.((((((.....)))))).)).......))))))))((((.....))))...((((..(((((.....)))))...))))(((....))).(((((((((((..((((((..(((((((((..((.(((((((((((((((......((((((((((......))))))).(((((((.((((.(((....)))...))).).)))))))..((((((((((((......((((((((((........((((...(((((((((((((((.....((((((((..((....((((((.(((((((((.((.(((.(((...........((((((((((..(.((...)).)))))))))))..((((((((((...((((((........)))...((((((((((.....(((...((((..((((((((...((((((((..(((.((((((.(((.((......)).))).)))).)))))............((((((.((((.(((..((((((((..(((((((((((((.((...((((..((..((((((((....(((......))).(((.((.......)).)))......)).))))))..)).)))).)))))).((((....)))).........)))))))))......(((((....(((((....(((((.((((((((((((.(((.(((....((....))..)))..))).))))))....((((.(((.((((((((((((((((.((((((.......))).))).))))).)))))).).))))))).)))).)))))).))...((.((((((((.((((.(((((((((.((((.((((((((...)))))))).(((((((((.(((((..(..((.((....))...))..)..)))))((((.(((((......))))))))).(((((((((....))))..)))))..))))).))))..)))).))))).)))).)))).).)))))))))..(((((.(.(.(((..(..((((((((((((((((((((.((((.(....).))))))))..(((((((...(((((...)))))...))).((((((........(((((...(((..((((....(((((....)))))(((..((((((.....))))))..))).(((((((............))))))).....((((...((((((((((.((((.......)))).))).))).)))).))))..((((..(((((((((....((((((....))))))...(((((((..((..(((.((((((((((..(((((......))).)).))).....))))))).)))..)))))))))....((((((((....)))).))))...)))))))))..)))).))))..)))....)))))......))))))(((((((((((.((....)).)).))).))))))))))....)))))))))))..)))))..)))).).))))))....)))....)))))..)))))(((((....)))))........))))))))))).))))))))))((((((........))))))))))))))...)))))).)).)))))))..((((..((...........))..))))..))))))))))..)))...)))))))))).))).))).))...))))))))).........))))))...))..))))))))((((((.......))))))....)))))))))))))))....))))...........)))))))))).....))).))))))))).....)))......))))))))..((((((.(((....(((((((((.(.(((.(((.....))).))).))))))))))..)))....)))))).(((((((((((....((((((((...........))))))))..))))))((((((.....(((....))).))))))...))))).................))))))).)).....))))))))).)))))))))(((((....)))))..((.(((((..(((....)))..)))))))......))))))))..)))))))))))))))).((((((.((....)).))))))..)))...))).)).))))))...)))))))))))))))))))).......))))))......((((....))))......(((((..((((((((((((...(((....)))...))))))(((((..((((..((.(((..(((((........))))).))).))..))))..)))))((((((......(((.....)))))))))........))))))))))).((((.((((((((((((((.(((((((.((((.....((((...(((((..((((......(((((.((((.(((.((.....))))).)))).))).))......))))..))))).))))...((((..(((((.....))))).(((((((..((.........))..))))))).((((.......))))))))...(((......)))....)))).))))))).))))..(((....)))...(((((.((((((.....(((((((.......((((.(((((.((..........((((((....)))))).............)).)))))...)))).....)))))))......))))))))))).....)))))))))).)))).....))))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({{(((..({....,||,,}||}{(((((((({,,((((((((.((((,{((((((.((.({((((((.((((((.{((,(((,.....,,|||,|.||}((((,,.|||||,...,,,,)))},.))),}),....)))))).))))))).)).)))))).}))))))))))))((((.(((((.....)))))..(((((.(((((((..(((,..((((((.({,.((((((.((((.,,({{{{{{..,,,.....(((((((((||....,,....,,,,)))))))..)))).))))))}}.))))))....))).....))))))).))))).)))).{{{....))}.,))))))))|,{....},,}..((((({.{{...........,...}).))))))))))))))((..{(((....((({.....}))),,)))}((((((...(((((((((((.{(((((.....((((((..(((((((.((((((((((((((((...((((((.,,.(((((.(((....))))))))..,,))))))))))))},}||.....,,,)))))))).)))))))....))))))(((((.......))))).(((..((((((({.(((.....{{((((((((..,{(((,,{,{((,{{{{{{{{...,|(((((((((...(((((((({{.{{{{((,....}}}}}}.)).......))))))))....))))).))))}.||{...(((((.....)))))...}))}|||}...)}}.(((((((((((..((((((..(((((((((..((.(((((((((((((((......{({(((((((......)))))}|{(((((,(.,,((.(((....))).,,})),)})),,}||..((((((((((((......((((((((((........,{{{...(((((((((((((((.....((((((((,{((,...((((({.(((((((((,((.(((.(({.........,.((((((((({..{,{{,...,,|||}}}}}}}}..|{|||{{{{|,|||{,|||......,.}}|,{{(((((((({(...,,((({..((((..,,((((((..,{((((((|,,{{{,{{{{{{.{{{.|{,.,,..)}.)}}.)))),)))))..,.,,,{{{,{(((((({(((({((({{(((,,,((,,{{{(((({..||||,|,,,|{{,..,(.,(((((((({{..{(({{,,,{|,|{{(.{{{,...|{{||.,{{{{,|,,(((,||.{{{.,,.(((({..,{{,,((({..||}})}|}}}}....))).}}},)}}....||{{(|||{{{.,,...,))}}||,.{((,((((((.(((.(((....({...,),..)))..))).))))))},,.(((((((.......,.))))))||{,{..,,{......,}))|})}|}}}))},)}))).)}))))))}|}),}}))}}|((|{((.((.((((((((.....))))))))))))))}.((((((((...)))))))),((((({(({.{(({(,,(,,(({((,..,||,..}},}),,)})}|((((.(((((......))))))))),{((((((((....))))..}))))..}||}}..}}}|}},))})))},,)))}.))))})}))))),..)}}|(((({{,{{(,.....))}.|},||||||{{{{||||,||((|(|...}}))}|{{{{.{(({(((({..{{{{,..(({(,,,,||||,((((((,,,,{{{,,((({,,,|||..,{{{|,,.(((((....}))))|||.,|((({{,,,,.}}})))|,,}}|},|}||...|||,|||,.,}}}},}}|{,,,(({{...|((({(((||.||||}}}|||{|}}}.)))))||{|,|,{|,,|{{(.|,..,.|)))..|}.}.||||||}}}})))})}..,|||{|{{..{{.,|||,||||||||{,,,({(((...,,,||},}|,.||,,||,,||||||,|||,,|,}||||||....{{((((((....)))),))))})))))}}))))},})))}})))}{|||.....))))...{{,,||||}(((((((((((.((....)).)).))).)))))).,|,..,,||||{((((({...||,,...,}},,))))))))))),.,..,)))})}.)}))})|||||}.,,)))))}}),..,{|||||||||}|,|||||||}}|((((({...,,}}.,}))))|||||||,...,}}|}}.,}.}}})))),|||||,,|},,..,,,,,,})).,})))).}}}}})))))})))}...}))))))))),})),))).}).,.))))))))).{{{{{{{.,,,,,,))}))}}))))))))((((((.,....,)))))).}..)))))))))))))))...,}|}},,...,}..,.)))))))))).....))))))))))))).,,},}}}......))))))))..((((((.{{(....(((((((((.{.{({.(({....}})}.,)).})))))))))..}}}....)))))).(((((((((((....((((((((,,.....,,..))))))))..))))))((((({.,{.{(,,....,))}))))))..,))))).......,.....,...))))))).)).....))))))))).)))))))))(((((....)))))..,(.(((((..(((....)))..)))))}),.....))))))))..)))),)},)))))))).((((((.((....)).))))))..},,...))).)}.)))))).}.)}})))))}))))))))))).......))))))......((((....}))}....,.(((((,.{(((((((({,,...,(({{{.,,,....)))))(((((..((((..,,.(({..(((((.,....,.))))).))).,,..})))..)))))((((({.....,(((.....)))))))))....,},.))))))))))).((((.((((((((((((((.(((((((.((((..,{{(,{,...{,|||,.{{,{{,,{{,{{,,,.((.({(.(((({{((.....))))))),))}.)}|....,}}}}.}}}}},}}}}..,{|,,..{{{{{..,..))))}.(((((((..((.......,.))..))))))).{(((.......)))},,,,...(((......)))....)))).))))))).))))..(((....)))...((({{{((((((.....(((((((......,((((.{(({(.((..........{{((({....|)}}}},.......,.,,,)).))))}...)))).,,..)))))))......))))))))))).,...)))))))))).))))...............,,,},...,}......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGGCUCGCCAUCCGUCCCCACCAGUCUCUACCUACUUUGCCCAGCUCCA… 3407 nt 0.4547
AUUGUCUCUGCCUUUACAACAGGUUCGGGCGGCGGGGAAGACGGGGGGG… 3553 nt 0.4571
AGUCCAGGGUCGGAGGGCUGAGGGGGAACUUUGCAGAGAGAAGGGUUUA… 3162 nt 0.4402
ACUGAGCAAUUGGAUGUGGGAUGUGAGAGAAAUGACUCCAAGGUUUUUG… 3329 nt 0.4323
UUUGGCAUCCAGGAGACCGUGCGGGAGACCGACGCUGAGCGCCGGCCUC… 3312 nt 0.4529
Summary

The protein encoded by this gene is a glycoprotein containing several von Willebrand factor C domains and epidermal growth factor (EGF)-like domains. The encoded protein acts as a homotrimer and is found in the cytoplasm. Several variants encoding a few different isoforms exist, and at least one isoform appears to be a secreted protein. Studies in mouse suggest that this protein plays a role in neural cell growth and differentiation as well as in oncogenesis. [provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NELL2 is an mRNA marker down-regulated with increasing age in peripheral blood, identified via microarray and validated by TaqMan qPCR [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014]. Subsequent research in a Chinese human population confirmed the NELL2 as a differentially expressed gene showing a steady decline in expression with advancing age and overlapping with genes previously reported in other studies [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373]. A study in humans identified Neural EGFL like 2 as one of the top 10 downregulated differentially expressed genes in peripheral blood samples from myocardial infarction patients compared to healthy controls [Zhao et al. DOI:10.3892/etm.2017.5580].