Basic Information

Symbol
NEUROD1
RNA class
mRNA
Alias
Neuronal Differentiation 1 NeuroD BHLHa3 BETA2 BHF-1 MODY6 Neurogenic Helix-Loop-Helix Protein NEUROD Class A Basic Helix-Loop-Helix Protein 3 Neurogenic Differentiation Factor 1 Beta-Cell E-Box Transactivator 2 Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor Neurogenic Differentiation 1 NeuroD1 BHLHA3 NEUROD T2D
Location (GRCh38)
2:181668295-181680827
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002500.5
Sequence length
2493.0 nt
GC content
0.4236

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-629.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -675.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 752.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002500.5 NCBI
ACGAGGAAUUCGCCCACGCAGGAGGCGCGGCGUCCGGAGGCCCCAGGGU… 2493 nt 0.4236
Summary

This gene encodes a member of the NeuroD family of basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factors. The protein forms heterodimers with other bHLH proteins and activates transcription of genes that contain a specific DNA sequence known as the E-box. It regulates expression of the insulin gene, and mutations in this gene result in type II diabetes mellitus. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the NEUROD1 gene, identified via microarray analysis as part of the brain's response to mild traumatic brain injury, was down-regulated at 12 hours post-trauma and subsequently up-regulated at 48 hours [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].