Basic Information

Symbol
NFASC
RNA class
mRNA
Alias
Neurofascin KIAA0756 NRCAML NF FLJ46866 Neurofascin Homolog (Chicken) Neurofascin Homolog NEDCPMD
Location (GRCh38)
1:204828651-205022822
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001005388.3
Sequence length
10336.0 nt
GC content
0.5470

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3745.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3922.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2285.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005388.3 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 10336 nt 0.5470
NM_001005389.2 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 2512 nt 0.5784
NM_001160331.2 NCBI
GAUUCCACCCAGGGCAGGGCUGCUGUGUUUUCUCUGAGGCCAACUUUCA… 10152 nt 0.5447
NM_001160332.2 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 10138 nt 0.5469
NM_001160333.2 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 2494 nt 0.5794
NM_001365986.1 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 9802 nt 0.5454
NM_001378329.1 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 10657 nt 0.5483
NM_001378330.1 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 2545 nt 0.5768
NM_001378331.1 NCBI
GAUUCCACCCAGGGCAGGGCUGCUGUGUUUUCUCUGAGGCCAACUUUCA… 2623 nt 0.5661
NM_015090.4 NCBI
GCGCACGGGCUGGUCUCUGCCCUAAUGCGGCGGCUGGCGGCGAGAGGCG… 10123 nt 0.5468
Summary

This gene encodes an L1 family immunoglobulin cell adhesion molecule with multiple IGcam and fibronectin domains. The protein functions in neurite outgrowth, neurite fasciculation, and organization of the axon initial segment (AIS) and nodes of Ranvier on axons during early development. Both the AIS and nodes of Ranvier contain high densities of voltage-gated Na+ (Nav) channels which are clustered by interactions with cytoskeletal and scaffolding proteins including this protein, gliomedin, ankyrin 3 (ankyrin-G), and betaIV spectrin. This protein links the AIS extracellular matrix to the intracellular cytoskeleton. This gene undergoes extensive alternative splicing, and the full-length nature of some variants has not been determined.[provided by RefSeq, May 2009]

Forensic Context

A study in human heart tissue from sudden unexplained death (SUD) cases identified the NFASC as a significantly upregulated gene in SUD cases compared to heart-healthy controls, where it is involved in cell adhesion [Neubauer et al. DOI:10.1007/S00414-025-03414-4].