Basic Information

Symbol
ARHGDIG
RNA class
mRNA
Alias
Rho GDP Dissociation Inhibitor Gamma RHOGDI-3 Rho GDP Dissociation Inhibitor (GDI) Gamma Rho GDP-Dissociation Inhibitor 3 Rho-GDI Gamma RhoGDI Gamma Rho GDI 3
Location (GRCh38)
16:280450-283010
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001176.4
Sequence length
964.0 nt
GC content
0.6795

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-475.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -491.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 242.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((...((((((((((((((((((((.((((((((.((((((.....((((((..((((((......)))))).)))))).....(((.((((.(((.((((.((((((((.((.(((.((((.((.((((.(((((..(((((.((((.....((((((........))))))(((((((.(((((.((((..(.(((((.(((((((((((((((((.....))))).((.....))......((((((((((((((((.((.((.((((((((((((((((((((............((((.(.((((((((....))).)))))...).))))..((((((.......))))))..))))))......))))))))........)))))).)).)).)))..))))))).))))))((((((((........)).))))))......(((((((((.(((.((.(((....))).)).))))))))).)))(((....)))........)))))))))....)))))))).)..)))).))))))))))))..((((((......))))))..)))).)))))..))))).)))))))))).)))..(((((...))))).(((((.(((.((((..((((((.(((....)))..))))))...(((((.(((((.((.((......)).))..))))))))))((.(((((((.((((.((...)).)).)).))))))).))..((((((......)))))))))).))).)))))(((((..((....))..))))).......)).))))))))......)))).))).)))).)))......)))))))))))..))))))))))))).))))....(((((....)))))...))))))...))))).))....((((.....))))..(((.......))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{,(((((((...((((((((((((((((((((.((((((((.((((((..,,,{(,{(((((,.(((((.((((((((((.((((((((.((((((((..(((((((..((({(({(((((((.(((((((...)))))))....))))))).))).)))((((((......,.))))))..(((((.(((((.((((..(.(((((.(((((((((((((((((.....))))){(({((,,{{.....|||{({(((((((((((.((.((.((((((((((((((((((((,(..({,,,...((((,{.((((((((,...|||.}}))).}.),})))..||{{|||,..,),))}})}).)))))),.....))))))))........)))))).)).)).)))..))))))).))))}},||||||{.,,{{...||{|||||}......|||((((({,(((.((.(((....))).)).))))))))),.))|||.,,}))}.....,,.))))))))}...,))}))))).)..)))).)))))))))))))))))..)}.}...))))))))))))))).))...)))))).)))))..))))}..{{(({,,,,|||||((,({|{{..,{{{||.{((({{{{{,(((((((((.((({...{((((((((((.({.((......)}.))..))}}))))))||.(((((((.((((,((...)).)).)}.))))))).||..((((((......)))))){{{{..,..,,,,.......,}|.,..)))})))),))))...)))}),}},))}))))})),},)},,,,,},}}),}},,.)))))))))))..))))))))))))).))))....(((((....)))))...))))))...)))}}.)).|..((((.....))))..,.|........)).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001176.4 NCBI
AGUCGCGCCGGGGCUGAGCGCCGAGCGGGGCGGCGGCGGGGCGGGCGGC… 964 nt 0.6795
Summary

The GDP-dissociation inhibitors (GDIs) play a primary role in modulating the activation of GTPases by inhibiting the exchange of GDP for GTP. See ARHGDIB (MIM 602843).[supplied by OMIM, Nov 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the ARHGDIG transcript was downregulated -1.5-fold in the dopamine cell-enriched ventral midbrain of chronic cocaine abusers compared to controls and was diagnostic for assigning subject cohorts [Bannon et al. DOI:10.1038/Npp.2014.70]. Research in mice identified the ARHGDIG as an overlapping gene in a conserved human-mouse neuronal sub-network associated with synaptic plasticity pathways [Ferguson et al. DOI:10.1007/S12035-018-1252-0].