Basic Information

Symbol
NFAT5
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Factor Of Activated T Cells 5 TONEBP NF-AT5 Nuclear Factor Of Activated T-Cells 5 KIAA0827 NFATL1 OREBP NFATZ Nuclear Factor Of Activated T-Cells 5, Tonicity-Responsive Tonicity-Responsive Enhancer-Binding Protein T-Cell Transcription Factor NFAT5 TonE-Binding Protein Tonicity-Responsive Enhancer Binding Protein Osmotic Response Element-Binding Protein Glutamine Rich Protein H65 NFAT-Like Protein 1 EC 3.6.3.14 EC 3.6.1 TonEBP
Location (GRCh38)
16:69565094-69704666
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138713.4
Sequence length
13289.0 nt
GC content
0.3924

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3308.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3583.79 kcal/mol
Frequency: 8.75518e-195
Diversity: 3583.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001113178.3 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 13286 nt 0.3923
NM_001367709.1 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 12813 nt 0.3895
NM_006599.4 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 13235 nt 0.3924
NM_138713.4 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 13289 nt 0.3924
NM_138714.4 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 13351 nt 0.3926
NM_173214.3 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 13297 nt 0.3926
NM_173215.3 NCBI
AGAUUCCUGUCAGCGGCGGCGGCGGUGGCGGCGACCGUCAGUUUUCGCU… 5326 nt 0.4600
Summary

The product of this gene is a member of the nuclear factors of activated T cells family of transcription factors. Proteins belonging to this family play a central role in inducible gene transcription during the immune response. This protein regulates gene expression induced by osmotic stress in mammalian cells. Unlike monomeric members of this protein family, this protein exists as a homodimer and forms stable dimers with DNA elements. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in porcine skin exposed to bromine vapor demonstrated that the NFAT5 (NFAT5) was significantly downregulated, showing an approximate 2.1-fold decrease in expression at 48 hours postexposure in both 10-minute and 20-minute exposure groups, as identified via microarray analysis and pathway analysis. A study in porcine (Sus scrofa) skin exposed to bromine vapor demonstrated that the NFAT5 (NFAT5) was significantly decreased approximately 2.1-fold in both 10- and 20-minute exposure groups at 48 hours post-exposure, as identified via microarray analysis [Rogers et al. DOI:10.1002/jbt.20383]. This transcriptional change was part of a common set of 30 genes shared among 19 significantly altered signaling pathways, indicating its role in the molecular response to chemical injury.