Basic Information

Symbol
NFE2L1
RNA class
mRNA
Alias
NFE2 Like BZIP Transcription Factor 1 LCR-F1 NRF1 Nuclear Factor Erythroid 2-Related Factor 1 Locus Control Region-Factor 1 NF-E2-Related Factor 1 NRF-1 TCF11 Endoplasmic Reticulum Membrane Sensor NFE2L1 Nuclear Factor, Erythroid Derived 2, Like 1 Nuclear Factor, Erythroid 2 Like 1 Transcription Factor 11 Protein NRF1, P120 Form NFE2-Related Factor 1 FLJ00380 TCF-11 Transcription Factor 11 (Basic Leucine Zipper Type) Nuclear Factor (Erythroid-Derived 2)-Like 1 Nuclear Factor, Erythroid 2-Like 1 Transcription Factor LCR-F1 Transcription Factor HBZ17 HBZ17
Location (GRCh38)
17:48047889-48061545
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003204.3
Sequence length
4839.0 nt
GC content
0.5485

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1855.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1940.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1053.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330261.2 NCBI
AAGCGGAGGCUCCGAGCUCUAGGCCGGCCGGCGGUGGCGGCGGCGAGGC… 4806 nt 0.5491
NM_001330262.2 NCBI
AAGCGGAGGCUCCGAGCUCUAGGCCGGCCGGCGGUGGCGGCGGCGAGGC… 4749 nt 0.5469
NM_003204.3 NCBI
AAGCGGAGGCUCCGAGCUCUAGGCCGGCCGGCGGUGGCGGCGGCGAGGC… 4839 nt 0.5485
Summary

This gene encodes a protein that is involved in globin gene expression in erythrocytes. Confusion has occurred in bibliographic databases due to the shared symbol of NRF1 for this gene, NFE2L1, and for "nuclear respiratory factor 1" which has an official symbol of NRF1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the NFE2L1 is part of a unique transcriptional program in immature cardiocytes entering the cell cycle after injury, where it serves a protective function [Li et al. DOI:10.3389/fcvm.2022.768834]. In human left ventricular tissue, the NFE2L1 mRNA was identified as a predicted target of the upregulated miRNA miR-339-5p following acute ischemia, with their expression showing a strong anticorrelation [Saddic et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00049.2015]. A study in mice demonstrated that α-particle irradiation of Kupffer and endothelial cells in the liver induced a characteristic inflammatory state and altered gene expression profiles, with specific down-regulation of the NFE2L1 specifically observed after Kupffer cell-specific α-particle exposure [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078]. In human pediatric burn patients, skeletal muscle biopsies revealed significant alterations in PPAR and mitochondrial gene expression, including the downregulation of PGC-1ß and upregulation of PGC-1α, PPARδ, and UCP2, suggesting a state of metabolic and mitochondrial dysfunction [Tzika et al. DOI:10.3892/ijmm_00000244].