Basic Information

Symbol
NFIA
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Factor I A KIAA1439 NFI-L CCAAT-Box-Binding Transcription Factor Nuclear Factor 1 A-Type TGGCA-Binding Protein Nuclear Factor I/A NF-I/A NF1-A NFI-A CTF Nuclear Factor 1/A C1DELp32p31 DEL1P32P31 BRMUTD
Location (GRCh38)
1:60865259-61462788
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001134673.4
Sequence length
9229.0 nt
GC content
0.4017

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2378.97 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2565.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2706.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001134673.4 NCBI
GGGGUUAAAGUUCAGCUCAUGGAGCGGCAAUAGCGCUGGCUGGCUGGCU… 9229 nt 0.4017
NM_001145511.2 NCBI
AGAGGAGAGAGGGACUGCCGAAUCGAUUGCAACUUCUGCAAAGUCUCGU… 9373 nt 0.3991
NM_001145512.2 NCBI
GAUUCCUCACCACCCCCGCUUCUGAAUGCCACAGGACCGAAGCUGCACA… 9338 nt 0.4031
NM_005595.5 NCBI
GGGGUUAAAGUUCAGCUCAUGGAGCGGCAAUAGCGCUGGCUGGCUGGCU… 9137 nt 0.4002
Summary

This gene encodes a member of the NF1 (nuclear factor 1) family of transcription factors. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NFIA was mentioned in a discussion as a regulatory target of miR-382-5p within an atherosclerosis-related axis [Zhuo et al. DOI:10.1186/s12944-019-1142-0].