Basic Information

Symbol
NFIB
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Factor I B NFI-RED NFIB2 NFIB3 CCAAT-Box-Binding Transcription Factor Nuclear Factor 1 B-Type TGGCA-Binding Protein Nuclear Factor I/B Nuclear Factor 1/B NF-I/B NF1-B NFI-B CTF HMGIC/NFIB MACID
Location (GRCh38)
9:14081843-14398983
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001190737.2
Sequence length
8576.0 nt
GC content
0.4031

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2235.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2399.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2424.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001369465.1 NCBI
AUGCUUUGUGUUUCUGUGCCACAGAGAAGAGAAAUGAACUGUGGCAUCG… 8032 nt 0.3896
NM_001369466.1 NCBI
ACUCCUGGAGCAGCCCCGCUAAAACAACAAUAAAACCCACCACACACAC… 8230 nt 0.3894
NM_001369467.1 NCBI
AUGCUUUGUGUUUCUGUGCCACAGAGAAGAGAAAUGAACUGUGGCAUCG… 7899 nt 0.3863
NM_001369468.1 NCBI
GAUUAGGUGUCUUAUCUUCCAUUGAGCUGCAUCUGAUGAAGGUUGCUGA… 7825 nt 0.3868
NM_001369469.1 NCBI
GAUAACUCCCACUUGGUGAAGGAAAAAGUCACUGGUUCCUCCAGGAUGA… 7827 nt 0.3866
NM_001369470.1 NCBI
ACUCCUGGAGCAGCCCCGCUAAAACAACAAUAAAACCCACCACACACAC… 8165 nt 0.3906
NM_001369471.1 NCBI
GCACUCGCUCACGCUGCCCCUCGCGCACACACAUGGUCGGCUCGCGGCA… 8351 nt 0.3996
NM_001369472.1 NCBI
ACUCCUGGAGCAGCCCCGCUAAAACAACAAUAAAACCCACCACACACAC… 8141 nt 0.3888
NM_001369473.1 NCBI
ACUCCUGGAGCAGCCCCGCUAAAACAACAAUAAAACCCACCACACACAC… 8138 nt 0.3887
NM_001369474.1 NCBI
AUGCUUUGUGUUUCUGUGCCACAGAGAAGAGAAAUGAACUGUGGCAUCG… 7819 nt 0.3855
Showing 11 to 20 of 29 entries
Summary

Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity; and transcription regulator inhibitor activity. Involved in brain development and regulation of DNA-templated transcription. Located in fibrillar center and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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