Basic Information

Symbol
NFIB
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Factor I B NFI-RED NFIB2 NFIB3 CCAAT-Box-Binding Transcription Factor Nuclear Factor 1 B-Type TGGCA-Binding Protein Nuclear Factor I/B Nuclear Factor 1/B NF-I/B NF1-B NFI-B CTF HMGIC/NFIB MACID
Location (GRCh38)
9:14081843-14398983
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001190737.2
Sequence length
8576.0 nt
GC content
0.4031

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2235.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2399.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2424.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001369475.1 NCBI
GCACUCGCUCACGCUGCCCCUCGCGCACACACAUGGUCGGCUCGCGGCA… 8218 nt 0.3979
NM_001369476.1 NCBI
AUGCUUUGUGUUUCUGUGCCACAGAGAAGAGAAAUGAACUGUGGCAUCG… 7810 nt 0.3855
NM_001369477.1 NCBI
GCACUCGCUCACGCUGCCCCUCGCGCACACACAUGGUCGGCUCGCGGCA… 8297 nt 0.3991
NM_001369478.1 NCBI
ACUCCUGGAGCAGCCCCGCUAAAACAACAAUAAAACCCACCACACACAC… 7916 nt 0.3861
NM_001369479.1 NCBI
ACGGCUGCAUGCCCCAGUGCCAAGCAUAGCAAGAAGAGACGCUUCCUUC… 7330 nt 0.3809
NM_001369480.1 NCBI
ACGGCUGCAUGCCCCAGUGCCAAGCAUAGCAAGAAGAGACGCUUCCUUC… 7241 nt 0.3801
NM_001369481.1 NCBI
GCACUCGCUCACGCUGCCCCUCGCGCACACACAUGGUCGGCUCGCGGCA… 1458 nt 0.4979
NM_001429577.1 NCBI
GCACUCGCUCACGCUGCCCCUCGCGCACACACAUGGUCGGCUCGCGGCA… 8692 nt 0.4040
NM_005596.3 NCBI
GGGCUGUAACCUUGAACUUUCCCAGCGCGGUGACACAUUCUCCCCGCUC… 8285 nt 0.3958
Showing 21 to 29 of 29 entries
Summary

Enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity; and transcription regulator inhibitor activity. Involved in brain development and regulation of DNA-templated transcription. Located in fibrillar center and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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