Basic Information

Symbol
ARHGEF12
RNA class
mRNA
Alias
Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor 12 LARG KIAA0382 Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor (GEF) 12 Leukemia-Associated RhoGEF Leukemia-Associated Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor KMT2A/ARHGEF12 Fusion Protein PRO2792
Location (GRCh38)
11:120336238-120489937
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015313.3
Sequence length
10326.0 nt
GC content
0.4363

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3076.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3276.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2544.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001198665.2 NCBI
AGAACCCGGCGAGCCGGCCCUGCGCCGGGAGACGCCGCCGCCUCCGCCU… 10269 nt 0.4364
NM_001301084.2 NCBI
AUCUGACAAAUGCCUUUCCAAGGAUGUCGAAUGUAUAUAUAAAGAAAAA… 9623 nt 0.4146
NM_015313.3 NCBI
AGAACCCGGCGAGCCGGCCCUGCGCCGGGAGACGCCGCCGCCUCCGCCU… 10326 nt 0.4363
Summary

Rho GTPases play a fundamental role in numerous cellular processes that are initiated by extracellular stimuli working through G protein-coupled receptors. The encoded protein may form a complex with G proteins and stimulate Rho-dependent signals. This protein has been observed to form a myeloid/lymphoid fusion partner in acute myeloid leukemia. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

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