Basic Information

Symbol
NFKBIE
RNA class
mRNA
Alias
NFKB Inhibitor Epsilon IKBE NF-Kappa-B Inhibitor Epsilon Nuclear Factor Of Kappa Light Polypeptide Gene Enhancer In B-Cells Inhibitor, Epsilon I-Kappa-B-Epsilon IkappaBepsilon NF-Kappa-BIE IkB-Epsilon IkB-E
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_004556.3
Sequence length
2344.0 nt
GC content
0.6041

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1028.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1066.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 609.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((.(((((((..((((..(((.........)))..)))).((((((((((.(.(((((((((((((((.....((((((((.(((((.((((((.((.(((((...(((.........)))....))))).))))))((((..(((......))).))))...)).)))))))).)))))....)).))))).))).)).))).).).)))))))))..((((((((((((((((((...(((((.......))))).))).))))))............(((((.....))))))))).))))).(((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((((((((((..((.....))..)).).)))............)))))))..)))))(((((((((((((.(((((..((..(((((.......(((((((..((((((((..((.((((((((((.(.((((.....((((.((((........)))))))))))).).))))))).(((((..((.((((......((((((....))))))((((((((.....))))).))).....)))))).)))))((((.((.(((.((((((((((((((((((((((.((((........................(((((((((.(.......)))))....)))))......(((((((((.(((((..(((((((((..(.(((((((((((...........)))))..(((......))).......)))))).))))))))))..))))).)))))))))..)))).)))...)))))).))))))))))))).))).))...))))))).)).))))))))(((.......)))....(((((((...(((((.((((..((((((.((((...((((((....)))..)))...))))((..((((((...((((((.(.((((((((((((((((....((.(((.((((.(((.((((.((............)).)))).))).))))..)))))....)))))))))).(((....))).((..((((..((((((((......)))))))).))))..))..((((((...((((.((((((((((((((((((.((.((((....))))))))).)))))..)))))...))))).))))..))))))(((.((((....))))))).)))))).).)))))).(((((.(((((((((....((((((((..((....))...)))..)))))..))))))))).)))))))))))))..(((....)))((((((.(((..(((((...)))))..))))).)))).((((((...(((..((((((((..((((....).)))..)))))))))))..)))))).((((......))))))))))...)))))))))...)))))))(((((((((.....))))))))).)))))))(((((((((.......))))...((((((...)))))).)))))((.(((((((((((..(((.(.((((((((((((((((((.((((((((((....)))....((((......))))..))))))).((((.((.....)).))))..))))))))))))).((((...((((..(((.((((((.(........).)).))))))).(((((....)))))............(((..(((((......))))).))).(((((((((((.(((......))).))).........(((((..........)))))))))))))((((((.(..((((((((........))))))))..).)))))).....)))).))))))))).).)))..)).))))))))).))..(((.....)))..)))))..))..)))))....))))))))))))).(((.(((.(((((((((((((((((.(((((..(.((..((((((((.((........)).)))))))).)))..)))))))))))))...............).)))))))).......)))))))))))))))))).....(((((((..(((((.(((.((..(((((.....)))))......((((....)))))).))).)))))..)))))))...))))))))))).))))))))))(((((((((.........))))))))).......)))))...((((((...((((.(((........)))))))..)))))).((........)).....((((........))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,.((((((({((((((((..((((..(((.....,...}))..)))){((((((((((.(.(((((((((((((((.....((((((((.(((((.(((((((((.(((((...(((.........)))....))))).))))))((((..(((......))).))))...)).))))))))}}))))....)).))))).))).)).))).).)}})))))))).}((((((((((((((((((...(((((.......))))).))).))))))...,,,......(((((.....)))))}}}}.)))}}.(((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((((((((((..((.....))..)).}.)))...,........)))))))..)))))(((((((((((({.((({(,,((..(((((......{(((((((..((((((((,.{{.{(((((({((.,.{{{{|{|,,||||.,,,,.,,,,,..}}))})||},,}.),)))))||,(((((,.((.((({......((((((....)))))){{((((((.....)}))).))).....}))))).||||}((((.((.(((.,(((((((((((((((((((((.((((..,({...................(((((((((.(.......))))),...,))))......(((((((((.(((((..(((((((((..(.(((((((((((........,..))))).,|||..,.,,}}}.....,,)))))).})))))))))..))))).)))))))))..)))).)))}..})))))},)))))))))))},)}).))...)}},)}),)).}}))))))|||.....,,)}},,,.(((((((.{{(((((.((((..((((((.{{{{...((,(({....}))..,}}..,||||{{..((((((,,.((({,,.|}||||{,((((({(((({{,.,{.{((,{{{{.{{(,{(((.((,....}}...,,}}|)|||{||,.|||,..)))}})},,))}}}|||||({(,{(({,((,((..((((..((((((((......)))))))).))))..)).)}{||||,.,||||.(((((((((((((((((,{((.((((....))))))))).)))))..)))},,}}))))).}}|},,||}}}|{.{{((((..{{||,,|,|||,,|||{,.,,|}|,.(((((.,{{{|||||....{{((({({{{,,....))...)))..)))))}},),))))))})))))))|}|}}||,{{{....)))|||,||,{((..(((((...)))))..)))||.||||..{.{{{...{{({{{(((((((..(((|....).)))..)))))))),.))))),,})}|{|{.,,}}.})),))))))...))))))))},}}})))))){((((((((.....))))))))}.)))))))|(({{{(((.......)))}.,,((((((...)))))).},,}}((.(((((((((({..,{{.{.((((((((((((((((((.(((((({{({.,,.|||....(({{....|.}}})..})))))).((({.{{...,.}}.}}}}..))))))))))))).((((...((((.,(((,({((({.{......,,|,||,||}}}}}.(((({....}))))...,.||||,.,|||..(((((......))))).})),{(((((({(((.(({......))).})}...,,||..|||||..........}}}}))))))))}{(((((.(..((((((((........))))))))..).)))))}..,,,)))).))))))))).}.}}}..)).))))))))).))..(({.....}})..)))))..)).,)))))....})))))))))))).((,,(((.(((((((((((((((((.(((((..(.((..((((((((.((........)}.)))))))).)))..))))))))))))).......{....,..},)))))))).......)))))))))))))))))).,,..(((((((..(((((.{((.({..(((((.....)))))......((((....))))}).))}.)))))..)))))))...})))))))))).)))))))),}(((((((((.........))))))))).......)))))...((((((...((({{(((........)))))))..)))))).||.,,.....|}.....((((........))))....,.,..,,.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUAACCGCUGGGUGGACCUGGCCAGCGCUCCGAACCUUGUCCUCGCUG… 2344 nt 0.6041
Summary

The protein encoded by this gene binds to components of NF-kappa-B, trapping the complex in the cytoplasm and preventing it from activating genes in the nucleus. Phosphorylation of the encoded protein targets it for destruction by the ubiquitin pathway, which activates NF-kappa-B by making it available to translocate to the nucleus. [provided by RefSeq, Sep 2011] CIViC Summary for NFKBIE Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.