Basic Information

Symbol
NGLY1
RNA class
mRNA
Alias
N-Glycanase 1 PNG1 Peptide-N(4)-(N-Acetyl-Beta-Glucosaminyl)Asparagine Amidase Peptide:N-Glycanase PNG-1 EC 3.5.1.52 FLJ11005 HPNGase PNGase CDG1V CDDG
Location (GRCh38)
3:25718717-25790039
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018297.4
Sequence length
2534.0 nt
GC content
0.4120

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-721.67 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -770.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 598.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145293.2 NCBI
AGUGUGGGACGCGGAGAGCGAGGGGCGGCGGCGGCGCCCGCUGGCGCUC… 2480 nt 0.4069
NM_001145294.2 NCBI
GCUUUCCCACGCACGCGUCCCGUUCGACUCUCUUUCCGCCGGUUGACUU… 2529 nt 0.4057
NM_001145295.2 NCBI
AGUGUGGGACGCGGAGAGCGAGGGGCGGCGGCGGCGCCCGCUGGCGCUC… 2356 nt 0.4130
NM_018297.4 NCBI
AGUGUGGGACGCGGAGAGCGAGGGGCGGCGGCGGCGCCCGCUGGCGCUC… 2534 nt 0.4120
Summary

This gene encodes an enzyme that catalyzes hydrolysis of an N(4)-(acetyl-beta-D-glucosaminyl) asparagine residue to N-acetyl-beta-D-glucosaminylamine and a peptide containing an aspartate residue. The encoded enzyme may play a role in the proteasome-mediated degradation of misfolded glycoproteins. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.