Basic Information

Symbol
ARHGEF15
RNA class
mRNA
Alias
Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor 15 Vsm-RhoGEF KIAA0915 ARGEF15 Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor (GEF) 15 Ephexin-5 FLJ13791 MGC44868 Ephexin5 E5 Rho Guanine Exchange Factor (GEF) 15 BSVD5
Location (GRCh38)
17:8310241-8323127
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173728.4
Sequence length
4196.0 nt
GC content
0.5901

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1647.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1719.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1161.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_025014.2 NCBI
ACUCAGCCCUGGGAGGUGACUGAGAGUGGAGGGGAUUCAAGGGGGAUGA… 4135 nt 0.5927
NM_173728.4 NCBI
AGAAUCACAGGAACACACACUUGGAAACCUCAGCCCUGCAUUCCUCGCU… 4196 nt 0.5901
Summary

Rho GTPases play a fundamental role in numerous cellular processes that are initiated by extracellular stimuli that work through G protein-coupled receptors. This gene encodes a protein that functions as a specific guanine nucleotide exchange factor for RhoA. It also interacts with ephrin A4 in vascular smooth muscle cells. Two alternatively spliced transcripts variants that encode the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ARHGEF15 mRNA expression was decreased in lung tissues following seawater drowning-induced acute lung injury [Chen et al. DOI:10.1016/j.lfs.2025.124109]. In human forensic research, whole transcriptome sequencing of heart tissue from sudden unexplained death (SUD) cases identified the ARHGEF15 as significantly upregulated specifically in the "secondary condition" subgroup compared to heart-healthy controls [Neubauer et al. DOI:10.1007/S00414-025-03414-4].