Basic Information

Symbol
NIBAN1
RNA class
mRNA
Alias
Niban Apoptosis Regulator 1 NIBAN C1orf24 FAM129A GIG39 Family With Sequence Similarity 129 Member A Cell Growth-Inhibiting Gene 39 Protein Protein Niban 1 Chromosome 1 Open Reading Frame 24 Cell Growth Inhibiting Protein 39 Protein FAM129A
Location (GRCh38)
1:184790724-184974611
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_052966.4
Sequence length
6884.0 nt
GC content
0.4547

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2193.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2315.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1443.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_052966.4 NCBI
AGAAGGCGACGCCUCUUGCCUCCUGUCUCUCGCCUCUCGAAGGAAGUUU… 6884 nt 0.4547
Summary

This gene encodes a member of the family with sequence similarity 129 protein family. This gene is highly expressed in several cancer cells and may serve as a prognostic marker for certain cancers. The encoded protein may play a role in regulating p53-mediated apoptosis. [provided by RefSeq, Sep 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NIBAN1 was upregulated during long-term weight loss (0 to 12 months) in weight losers, with its expression pattern showing an opposite direction in acquired obesity when validated in BMI-discordant monozygotic twin pairs [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].