Basic Information

Symbol
NID2
RNA class
mRNA
Alias
Nidogen 2 Osteonidogen Nidogen-2 NID-2
Location (GRCh38)
14:52004809-52069059
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007361.4
Sequence length
4870.0 nt
GC content
0.5234

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1646.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1737.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1291.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007361.4 NCBI
GGAGAGUGGGCUGGAGGCCGGGGCGGGACGCGUUGUGCAGCGGGUAAGC… 4870 nt 0.5234
Summary

This gene encodes a member of the nidogen family of basement membrane proteins. This protein is a cell-adhesion protein that binds collagens I and IV and laminin and may be involved in maintaining the structure of the basement membrane.[provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NID2 gene, involved in cell adhesion, was up-regulated in abdominal subcutaneous adipose tissue in response to a 7-day overfeeding intervention [Shea et al. DOI:10.3945/ajcn.2008.25970]. In a separate human study, integrative genomic analysis of ovarian cancer identified the NID2 gene as a potential biomarker, where it was a member of a multi-dimensional module overlapping all three analyzed data types (gene expression, DNA methylation, and microRNA expression) [Zhang et al. DOI:10.1093/nar/gks725].