Basic Information

Symbol
NLGN1
RNA class
mRNA
Alias
Neuroligin 1 KIAA1070 NLG1 Neuroligin-1 EC 3.1.1.1 EC 3.1.1 NL1
Location (GRCh38)
3:173396284-174294372
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365925.2
Sequence length
16241.0 nt
GC content
0.3392

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3683.45 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4010.17 kcal/mol
Frequency: 5.95728e-231
Diversity: 5090.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((.((.((((((((((((.(.(.(.((((((.....))))))).).).((((((.(((......))).))))))((((((((((.((.(......).)).))).(((((.(((.((((.(((((((....))))......((((.....)))).......((((...((((((((((..(((((..(((.....)))..)))))..))))))))))))))...(((.......)))..(((((....(((((((((.......)))))))))..)))))...(((((((.((((((..........(((((..(((.......))).)))))....((..((((((....(((......)))..))))))..))..)))))).((((.((.((...((((...(((.((.((((((....(((.(.(((.....)))).))))))))).)).))).)))).))))))))...((((((((..(((((((((....((((((......((((((........))))))..(((........))).((((.....))))........))))))....)))))))))......((.(((((((((((..(((((((..........((((...((.((((((((((....)).))).)))))))..)))))))))))...))))))).)))).))...((((.(((.....))))))))))))))).))))))).(((((((.((((..(.(((((.(((((.((((....)))).....(((((((.((((((.(((((((((...(((....)))........((((((((...((((((....(((((.......(((((((.(((((.........(((((((.(....).)))))))...((((((((((.(((((((((((.....(((((.........(((((.....)))))...(((((.(((((......(((........)))......))))))))))((((......))))((.((((((.(.(((((((((.((((((((...(((.((((((((((((.......((((.........(((((.........((((((((..((.((((.(((((((....((((((((........((((.(.....).))))..................).)))))))(((((.......)))))..((((....)))).))))))).))))))..))))))))..))))))))).....)))))))))))).)).)....)))))))).(((.(.((((((((.((..((((.......))))..))((((((((....)))))))).)))))))).).)))...((((((((.....(((((((.((.(((.(((............(((((((((((((...(((((((.((.((...))))..)))))))..))))))))...))))).(((((((((..((.((((......))))..((((((((((.((...((((....((((((....))))))((((((.((........((((....))))...((((((((((((.........)))))))).((..((((((((((.....))).))...)))))..))...(((((((((.(((((((..(...(((..(((((.((((.....))))..(((....)))......))))).))).)..)))))))))))))))).....))))..)))))))).))))..)).)))))).))))......))...)))))))))...)))))))).)))))))))))))))..(((...........))).)))))))))).)))))).))....(((((((................((((((((((((....(((((((((((((..((((...((((((........(((..(((((.((((...((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))))).......((((.((.....))))))......))))))..))))..))).))))))))))........((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....((((....)))).....))))))))))))..)))))))..)))))..)))(((((((...))))))).)))))))).))))))).)))...(((....)))))))).)))))))....)))))))))))..))))))))..........(((.(((((((.((.((((((..(..((((((................((((((((......)).))))))...(((((((............................)))))))((((((..(((.....((((.....((((...(((((((((...((((...))))....(((((.(((.................(((.....)))....)))))))))))))))))......))))....))))..)))..))))))))))))..)..))))))..((((((((...((....))...)))))).))...(((.((((....)))))))(((((.((((((...((((((.((((.((((((((((.((..(((((....((..(((((((...)))))))....))(((.(((((.......))))))))......(((((.(......)))))))))))..)).)))))))..))).)))).(((...........)))....).)))))..))))))..))))).......)).))))))))))..))))))(((((((((..(((((.((....((((..........))))....))..)))...))..)))))))))....))).)))))))))))))....(((((((((...)))))))))...((.((................)).)).)))))))))).).............))))))))))).........(((.((((............)))).))))))))))))).)))))...........(((.((.((((.......)))))))))......))))))).(((..................))).....(((..(((((((((.......))))))))).)))....((((........))))..)).)))))))))).)).))...(((...(((.((((((((((((((((((((((((((....))))))((((((.((....)).))))))......(((.(((((....))))).))).................((((((((...))))))))...(((((((.......)))))))..((((((((.....))))))))..............(((((...(((((((((((....)))...((((((((.........((((((((((((((...................(((...(((((..(((((((....)))..(((((((......((((((.(((((.....)))))(((((...((((((..(((.((......)).))).....)))))))))))((((((((.((((((((.((((((........)))))).((((((((((.((((......))))....)))))))))).....((((((((((..((((((..(((((..((((..............))))..)))))..)))))).))))).))))).........((((((((((......))).))))))).(((((((.....(((....((((.(((((((((((..(((..(.(((..(((.....)))..)))))))..)))))))))))))))...)))))))))).................(((((((.........))))))))))))))).)))).))))....(((((....)))))))))))......)))))))...)))).((((....))))..((((((.(((((((((((((..(((..(((.....(((((....)))))..)))..))).(((((.((..((((.((....(((((.(((.(((((((.(((.((.(((((((..((....))))))))).)).)))..))))))).)))..)))))))))))..)).)))))..(((.((((.((.((((.(((((((............((((((((((((((((((...((((......)))).............((((.((((((..((((((.....((((((.........(((((.((.((((((.....(((.....(((((((.........)).))))).....))).....))))))))))))).........(((((((....)))))))((((((....)))))).................(((((....(((((.(((........((((((........))))))........)))..)))))....)))))...))))))...))))))..)))))).))))......))))).)))).)))))))))..((((((........((((.(((((((((....((((...((((((((....((((((.(((..................))).))))))......))))))))..)))).((((((((((((..((((((................((((((.((((.......)))).)))))).(((((((....)))))))....(((((((....)))))))....((.(((((.....((((((((((..((((((......))))))..))))...))))))....(((((.....((((...))))....((....((((((.......((((......))))....))))))...))((((((.((((((((((((((...............)))))))..)).)))))))))))........(((((((((...((((......)))).....))).))))))((((((((((..((((..((......)).........((((((((.............(((.(((((...))))).)))...............))))))))))))..)))))))))))))))..))))).))....)))))).....)))))))))))).(((((((.........)))))))..(((((...(((((((.(((((((((((((((((((...((.((........)).))..((((((((((.(((((.......(((((.......))))).((((..((((.((((((((((........(((((((((..............(((((.........))))).((((((..(((.((...((((((.((((((....................((((((.(((.........(((..(((((....)))))))).........))).)))))).....(((...(((((((.......................(((.(((((((((...(((((((........))).)).)).......))))))))).)))((((((((((..((((....))))..))..((((......))))......((((((((((..(((((((((((((.....)))))..)))))))).)))......)))))))....................................(((((((........)))))))...(((((......)))))....((((((.((((...)))).)))))).....))))))))............)))))))...))).)))))).))))))..)).))).........))))))....)))))))))(((((.(((((((((((((((((((((((...............)))..))))))))))).))))))))).)))))....((((((.....)))))).)))))))..))).))))..))))....(((((((((...)))).)))))(((((.(((((((..((((((((.....(((((((.(((((((((.((((....((....))....)))).))))).)))))).)))))...)))))))).))).)))).)))))..........(((((((((.........(((((((((....)).)))))))))))))))))))))..))))))))))(((((((((.((((((.....................((((..(((((......))))).....)))).............((((((....))))))((((((......))))))..............))))))))))))))).(((((((......((((((((..((((((...((((........)))).))))))..)).)))))).......)))))))..(((((((((.......((....)).......))))))))).....)))))))))))...((((((.........(((.....)))..(((((.((((((((.....)))))))))))))..........(((.((..((.((.((((.(..((((((((.......((((...((((.(((........)))..)))))))).........))))).)))..).)))))).))..)).)))......)))))).(((....)))......(((((((((..(((((.........))))).))))))))).)))))))).)))))))...)))))..((((((((((((((((........(((((((....)))))))))).))))))).))))))...................((((((..(((((.....))))).....)))))).((.((((((((((............(((..(((....(((((((((((...........(((.(((.....((((.((((..(((((((.(((((((...(((((..((..(((..(((((((....))))))))))..))..)))))....))))))).)))))))..)))).))))....))).)))...........)))))))))))...)))..))).(..((((........))))..)....(((((((((((((.......(((....))).....))))))..((((((..(((((...(((((((((((((.(((((((((.........((((.(((((..((((((((.(((((...((...((((((((((..(((((....)))))(((((((((((..((.((.(((.........(((.....(((.(((..............))).))).....)))))).))))..)))))))))))(((((((.(....(((((((.......(((((...((((((((((...........((((..((((((.(((((((((((((((...(((((.((....(((((......)))))..)).)))))..))))))))...((.....))(((((((((((......)))))......((((((.((((....................)))).))))))..((((((..(((((.(((((...(((.((((.....))))..........................(((((((((((((((((((((((((((((.((......)).))))))).....))))))(((((.((......)))))))(((((((((....(((..(((((..((........))..)))))..)))....))))))))).................)))))).)))))))))))))..))))).)))))....))))))(((((((((((((((..(((((((.....)))))))..))))))))))).)))).....)))))).......((((((.(((.((((...)))).))).)))))).........((((..((...))..)))).............((((((((........)))).))))..))))))).))))))..)))).))))))))))))))))))))))..))))))))...))))))))))...)).)))))..)))))))).)))))))))((((....))))))))))))).))))))))............).))))..))))).)))))).......(((....)))))))))).((((((((((((....(((((((.((((.....))))...))))))).........))))))))))))........)))))))))).))(((((((((.....)))))))))((((((((((((((((.......(((.(.(((.((.(((.........((((((((((((((......))))))......))))))))))))).))).).)))..........(((((((((((((((((((((.(((((.....))))).))..(((.(((((...(((......)))..))))).)))..(((((((....((((((..(((((......)))))...((((((((((.((((...((((((....))))))(((((((((.(((((((.....)))))))(((.((((........(((((...))))).(((((.(((((((((((.((((((.........((((....(.(((((((.(..((....((((.(((((.....)))))...))))...))..).))))))).).)))).((((((((((((((..((((.(((((..(((((((.....)))))))(((((.((((....)))).)))))...))))).))))....((((((((.................))))))))...................((((((........)))))).(((.((((.((((((((.......((((((((.................))))))))..(((((.(((((((....)))))))(((.....((((((((((..(((..(((((...((((((................))))))...)))))..))).....)))))).)))).....)))..)))))..)))))))).)))))))..........(((((((.(.(((.(((...((((..((((((..(((((((((.....((((....(((((((.(((((.((((((..((((((.(((..((..((((((.(.......).))))))..))..))).)))))).)))))).....))))).))).))))..))))..)))))))))....(((((((.....(((((....................)))))..)))))))))))))..))))...))).))).).)))))))..)))))))))))))).(((((((....)))))))((((((....))))))...)))))).)))))).(((......)))))))).)))))..)))).)))(((((((.....))))))).....(((((.....((((((....(((((((..(((((...(((((.(((((....(((((((.....))))))).....(((((..............(((......)))..(((((.(((((((.(((((((((.((((((.....))))))...)))))))))........(((((((((((((((((((.....)))))))..........((((((((((........))))))))))..(((((.......((.(((((..(((((((((...................)))..(((((((.....))))))).......((((((((((...((((((.(((((((...)))))))....(((((((...(((......(((((((((((...((((...................(((((((((((((((((........((((((.....))))))((((((....(((((..((((((((((((((.((...........................)).))).))))))...))))).....((((((((((...)))))))))).................((.((((((((.....(((((.............))))).................(((((((...((.(((((..(((.....(((((((.((.((.(((((.(((.((.(((((((.(((..((((((((.....((((((((.((((((..(((((((((.(((((((((...(((.(((((((.......(((.......)))........))))))).((((...((((((.........((((((((...(((.....(((((...(((((..................)))))............(((((((....(((((.(((((...(((.((((((((((..((((...((((.(.(((..(..((((.....((((.(.(((((....(((((.....)))))....)))))).................(((((((((......))))).)))).............(((((((.((((....((((((((..((((((.((((..(.(((..((((..........(((...(((((...(((((....))...)))..((((.((((((.......(((((.(((.(((......))).))).)))))........((((.(((..(((((.(((..(((((...........)))))..))).............((((((((((((...((((.......))))...))).((((((((.((...((.....................))....)).))))))))....((((((....(((((((((((((((((((....((((.((....((((((((.................))))..))))......)).)))))))))).............((((((............(((((.((........)).)))))..(((((((((.......(((((((..........)))))))((((((((..((((((.........))))))..))))))))..))))))))).))))))....))))))...))))))).(((....))).........(((((....((((.((((((.((((...((((...(((((((.(((((((((..........)))..)))))))))))))...(((......)))((((.((((((((.....(((((..(((((....((((.......(((((((((.((((...(((((((((......))))...........((((......))))..)))))...)))).(((((.......))))).((((((.(((.(....)))).))))))..)))))))))((((((...........))))))(((((((........)))))))))))....)))))..))))))))))))).))))............((((((......))))))((((........))))..((((((............))))))....(((((....))))).....)))).)))))))))).))))...)))))..............((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))................)))))).......(((((.((....)))))))...)))))))))......)))))..))).))))..(((((..((((((((((.(((...(((((((((.(((.....((((.....((((((......))))))......))))....)))..)))))))))..((((......))))...(((((((((((((..((.(((((((.((.((((((.((((((..(((((.(((.(((....)))...))).)))))..)))))).........((((((......))))))....((((........))))......(((((.(((((((......((......)).............(((......))).............(((((((.((.(((((((..(((((......................................)))))...))))).)).))))))))).......)))))))))))))))))).))((((((((((((.(..............................(((.........))).........((((....))))..).))))))))))))........((((..((.((((((((.(((...(..((((...........))))..)...)))..)))))))).))..))))....(((((............))))).))))))).))............................(((((...((((((....))))))))))))))))))))))))......))).))))))))))..))))).......((((((.(((((((.................................))))))).))))))..)))))).)))).((((.....)))).........))))).)))..........))))..))).)...)))).))))))....)))......)))))..........)))).)))))))......(((((((........)))))))...)))).....))))..)..))).)))))....))))..)))))))))).)))......((((.....))))))))).))))).........((((.....))))......(((......)))))))))))))))....)))..))))))))))))))..))))......................)))))))))))).)))))))))...............(((((((.....(((......)))..((.......))............((((........))))((((((....((((((..((((((.((((......)))).)))...)))...))))))....))))))............((.(((....))).)).........))))))).....((((....))))....)))))))))))))))))))).))..)))))))))))))))....((((......)))).....))))).)).))))))))).....)))..))))).))....)))))))....................(((((...((..(((......(((((((((.((....)))))))))))(((.....)))..)))..))....)))))..)))).)))))))))))..))))))......)))))))))))))))))...(((((.((.(((.(((.....(((((.((........)))))))....))).)))))..)))))......))))))).))))))))......((((...((((..((.....))..))))...))))))))))))))......((((..(.(((.((........))))).)..))))............((((((((((.((....................)))))))))))).........((((.((((((((((....)))))))))).)))).(((..((.((((...)))).))..)))((((((.((.....(((((((.......))))))).....)).))))))........(((.......)))..)))))).....)))))))))).))))))..))))).))....)))))..))))))))).)))((((((((((..............))))))))))...((((.....))))(((.(((.(((...)))..))).))).))))))))))))...(((((.........(((........))).........)))))))))).......)).))).))))))))))..)))))))..))))))..))))).(((((((..((((....)))).))))))).............(((((..(((((........((((.((.((((.((.........)).)))).)).)))).....((((..((((((....))))))....)))).......((((......))))................((((((((((.....((.(((((..((....(((((((((((((((((....)).......................(((((((..(((.((.((((((((((((....(((.(((((((((((.(((((((....))))))).)))).....)))))))..)))..........((((((((......))))))))))))).....((.(((((((....))))))).)))))))....)).))...)))..)))))))..)))))))))))))))))..)))))))))).))))))).....(((((.(((((....(((.(((..........))).))).....))).)).)))))...)))))..)))))..........(((((((((((((.((((((..((((((((((.............))))))(((((..............)))))...((((((.((((((..((((((((((................)))))))))).))))....)).))))))..(((((((((((((((...........))))))))))...)))))(((((((((((..((((((..................(((((...((((....))))......)))))..((.((((((..........))))))))((((((((((...((.(((((...........))))).))..)))))))))).....))))))..))))).))))))...............(((((((......)))))))..)))).))))))))))))))))))).........(((((((............)))))))...(((((((((...((....(((((............)))))..)))))))))))....((.....))...)))))..))))..(((((......((....)).....))).)))))).))))))))))..((((........))))...((((((.....(((((...))))).....))))))......))))))..))))))).))))))))).......))))))))))...))))))))).)))))))..((((((.(((((.......))))))))))).(((.(((.(((......)))...))).))))))))))))))))........)))))).(((((((((....)).)))..))))))))))))))).)).)))).)))((((((((((((((((((((((((.........(.((((........)))).).........))).))))))))))......))))))))))).....))))))))))))).))))))............................((.((((.(((.....((.((((.....((((((((((..((((((((..((((((((((((....)))..)))))))))....((((((((.....))))))))...((((.(((((((((....))))..(((((....)))))...)))))..)))))))))))).)))))))))).......)))).)).....))).)))).))...................))))))))))))))))))))))..((((((((.(((((((((....((((......))))))))))..))).))))))))......))))))))))))))))....))))))))))))))))))).)))))))))...)))......((((....(((.((((.((((((.......((((((((....))))))))......)))))).)))))))...))))...))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({.(((((((((((((((.(((({.(((((.(.(((({((((((.(((((,....}),))).)))))),,.((((((((((((.((((({,(((({..,((((((..(((((({({,(({..((((((({(({(.({(((.{{(((({{{(.,,|{,,.{,.,((((.,,((((((((((..(((((..(((.....)))..)))))..)))))))))))))}...,|}|,.{{({(((({{{(((((,.,((((((((.......)))))))),.,((({{,{{,|||.,.(((..,{{,|||...,,(((,(((,((.{{{.((||{((((,,..{{,,.{({.,,.....|||.}}...,))}})))).)}},)}.}))..}|}.{,|||||....|||....(((,((((((....))))}}.,}}}}.....,}}}}.}}}})).}}}}})))})),,.,,,,,|},...||{{((({,{({{{{((((.,{{(({,,{{{|.||((((((........))))))..{||.|,},..}}|||{{||...,}}.))}}}.,,},}}}}}},,,.}}}|}}},,......((.(((((((((((..(((((((..........{{{{.,.((.((((((((((....)).))).)))))))..}))})))))))...))))))).)))).)).,|||,|.||||,,,}))))))))})}}}},)))))))...))),)))))...})}},{{{||||||,|{{{..,,))),.....,|{({((((({{.{{{.{((({(({{.{{{....|||,,...,{{((({((.(({..(((..(((((..........))))).))).}}}.)}..}))))}|{{{||,|,...}.))))))}}},...)))|.|}}}})))}}}))))},,,}..,,,.,,)))))|{|||}....,)))......)))))).)))))))))))))))))))).,,...{{{(((((((((((((......))))((.((((((.(.(((((((((.{(((((((.,,{{{,((((((((((((,......{{{{.{{,..,.,|}||{((({......})}}}((((((({((..((((((.......))))))..)}....((((.{.....,.)))).....{{{{.{........}.)))))))))))).{||{||||,,..{(({....}))},{{{,((((({{({,..|||,})))}},||},}||}.....}}}}}}}}||}|,||{|,,,,||||||}}.(((.(.((((((((.{(..((((.......)))),})}(((((((,....,))))))).)))))))).).)))..,(((({{({.....|||||{{.((,{({.{{,..........{.((((({(((((((...(((((((.((.((...}))),.)))))))..)))))))}...))))).|((((({(({.{{{((((..{{{{||||{{((({,{,{{{.(({{{(((({{{{((((((....)))))},,,,{(,{{,,,.....((((....))))...((((((((((((.........)))))))).....{(((((((((.....))).))...))))}}}))...|||||||||},,,,|||}}|}..,,|}}|||||}}||}..,|.,,}},.,.},,.}})}.,....}))))}}}}.},,)))))))}}})))}}},,,,.,}||,..}))))))},,})}})).))))})})))),..,,,}}.,,))))))))}...}))))))),))))}})))))))))..{,,,.,,,....))))..)))))))))).)))))).))......{((({{....,,,,,{{{{..((((((((((((....(((((((((({((..((((...((((((......,,,,{,{(((((.((((.,.((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))),,.....,.((((.((.....))))))......))))))..))))..})).))))))))))..,.....((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....|{{{....,,}).....))))))))))))....(((((.((((.(((((((((((((...)))))),,{{{,,.(((((({{({.....,((((,,..}}}|..{{{{|{.{{...{,{{{,,,(((.(((.((((((.((((({((.,(((,,..{{,((.(((((((....))).)))).))...,{{{{.....((((((((......)),})))))....}}}}},..,....}}},))},.............}))))).)))))).))).)))...},,}})),,,}.........(((({.{((....((((.......))))}}}.}}}}}.,,.....}}.|||}}}.})).}}})))),,,}}.))))))).)))).)))))..........,}}|....,,}.},}},...,,}})}}},,......))))))))).|}|...,....,|||...(((.((({....})))))).}}}.)))))))))})))))).))))).(((((((((.(((..{{(..,,.....(((((({...})))))),,..({(((.(((((.......)))))))).)).}))..)))))).)))).)))))...}))))...)))))))..)))))))),,{{,{{,,,,{{{{{{...((((.((((((((.,((,..((((.(((.((.....))))),..)).}}.,||,.,.....|,|.........,.}),.))))))))))))....{{{.,.{{(((((((((({,,{(({(((,,....))))))|||{{{{{(((((((((...)))))))))...((((((.{(.((((((,,...{{.(({{{(((..(((((.((((...............}))).)))))...}))))})},...........(((((((,.(((((...((.(((({..........(((.((.((((.......)))))))))...,,,{....((((((({(({{{{.......,,,((({..((((({.,{(((((({.......}))))))}}.,{(({{.((((........))))..}}}})}))))))....,))}......{{{,.,.......}}})},}}.....,|||||}}...,,,,,..........))))))),{{,,......(((.(((((....))))).)))..}},.,..........((((((((...))))))))...(((((((.......)))))))..((((((((.....)))))))).......,,......}}}}..((((((((({,.....((.....)).....,},))))))))...............................))))).))...))))).(((....)))..{((((((......((((((,(((({.....})}}}(((({..,((((((..(((.((......}}.))).....)))))))))))((((((((.{(((((((.((((((........)))))).((((((((((.,(((......)))}....)))))))))).,,,{((((((((((..((((((..{((((..((((..............))))..))))}..)))))).})))).})))},,..,,,.,{{{|||||((,,,|,.|||.}}}}))},|||,{{{,,,,,((({{..,(((.{((((((((((..{{|.,||{|{,.(((.....))).,),,.}}}..)))))))))))}))),...,|}||||||.......,,,,,,.,.}||||{{{......}},}))}}},)))))))}.))))}}}))....{((({....)))))))))))......)))))))))))))).,.........((((((((((..,.(((((((({{(((((((((......{((({....)))},.(((...(((((...((((((((({((((((.((((..((((((((((({,.((((((,{{,,({((((({,{{,,.,(((..((((((.....(((((..(((((...(((......))}.(((((((((.,.,{{,{(({..{{.(((((((((((.(((((..........)))))...((((((((....{({{.......}}}}...............{(((((((((({.......,,.,..{((((.((,((((((.....(((.....(((((((.........)).))))).....))).....))))))))))))|......,,,{((({{(.,,.|||||||((((((....)))))|......,,.,,,|{{|{{|||{,,,,{{....,,{{,.{{{{|||||,||||.{{{{{{{((((...((,((..(((((({.,{{({.(((((((.,......)))))))..}}},}}}........,,,,((((..(({...)))..))))||,,,......{((((((((((({{,{.((.,.((((((((.{{{{...{{{((((((,,,,{{,.|||.|{{{{(((.(((((((((.{{{({{({{.{{{{,,,,|||.,|{|||,({{{({,.({({,{.,,{{{{,{(.((((((.((({.......}))).)))))},(((((({....}))))))....(((((({....}))))))....{(.(((((.....((((((((((..((((((......})))))..)))),..,}}}}}....{{(((|,,,,||||...}|||,..,((,,.,((((((..,,{,,((((......))))....}}||||.,,}}((((((.((((((((((((((.......,,......)))}}}}}})))}}})))))))).,{{{{{.(((((((((...((((......)))).....))),}))))).||||||({(,,(((,..((,..,,,||...,,....((((((((,,,..,....,..(((.(((((...))))).)))..,.....,.,....))))))))}}}},.||||,,,},}}}}}}..||}}},||...,|||,,|,{{,(({{{{{.,{}|},|{{{|{|.,..{{{{{,,,||||....,}))),,))}}}.,||||||||}}}},}}},}}.,,,,}}}}}}.,,}}}))))))))..,)))}}))}.}},}))))}|||||,,,,,..}}))},||||,,{{{,.,,,{{||{||,,,,....(((((((((....,{,.{{{...,,.}|}..,,,..{{(({,.{(((((,,(((.((.,.{(((((.(((((({,{.................(((({,..||,,.......(({..{((({....)))))))).........,}}.}})))}.....{||...(((((({......,.,.............{(((.(((((((((...,{{{{{{........}}},)},,,.......))))))))).)))|{{{{{,{{(,.{{,....{||||,,||{{{(((.,.{{,.,,,.,,,,,{,|{{{{(,,.}||||{{||||||,..||}},))),}}|},}}}}||||......,.,,,,,.........,,,}...,,,,|||,...,.......,(((((((........))))))).,.|{{{{,.....)))),.,,,{(((((.((((...)))).)))))}....((((|..,........})})}}))))))..,))}.,))))).)))))}.,)).)))..,,.....))))))}}}}))))))))){((((.(((((((((((((((((((((((...............))}.,))))))))))).))))))))).)))))....{{{(((,,,..}}}|||,|||}}}},{|||,||}|,|}}|,,,|,|||||||||..,)))}||||}},|(({|({(((((..((((((((.,,..((((({(,(((((((((.((((....((....))....)))).))))).)))})))))))).,.)))))))).}}}.|}}|.||}}}.,}|},,,.,{{{{{{{{|||.,,.,},,,,(((((({{{,||||.|||||||||||||||{,{,..{{{||,,{|||,|{,,|,,|||}},.,,,,,.,,..,,.,))}))),)}}}}}))))))),,,,|}},|{{{{{|},{{,{,|{|,..,,}|||||{..,,)))))}|{{||{|,,...|||||,......((((({......))))))}|||||||||{,,,,,......,,,,,.,|||||{{,..|||||||,,||||||.{|||||,,||||{{|,..,,,..,}||||{{,{(((((((((.....,.{{....)).......))))))))}....||||...|||,,.}}}.)))).....,,,,||||....,,,..(((((.((((((((.....))))))))))))),,,,.....}}||||,||||},,..|||},|||}}}.,}}},,}))}},,}})))},}}|||||}}.|||||,{{(((.||||......,,{(((((...{((((,,.}}})),,,|{||}||{(({||{{{{,.,{({{{{||{{{{{{{{{{({{{{{..{{(({.........}}}}}.})}}))}}|((({{{{{{,{{{{.,,..,,|||,..((((((((((((((((........(((((((....))))))))))},))))))},))))),|{,..,,{{,,|{{,,,.{(((((..(((({.....))))).....}}}}}|{{,,{|{||{{{{{|||||,,,|,,.{{,..,,,....{((((((((((...........(((.(((..,..((((.((((..(((((((.((((({{.,,(((({..{(.,((((.(((((((....)))))))}))}}))..}}}}),}}})}))))),)))))))..)))).))))..}.))).)))...........))))))))))|{{{|,,..,,)}}},,{{{,|.....,)))}}})},,,||{|||||{{|{{....,{{(({,,,,|||,|...}}}}}}..((((({.,(((((,,,({{{,((((((((.(((((((((({.,,...|||{..(((((..((((((((.(((((...({..,((((((((((..(((((....)))))(((((((((((..((,((,{{,.....,...{{{{,.{,{{,.{{((,{,,,....,,..,,,,,,,...||||)}|},,,,,..))))))))))}{((((((.,{,..{((((((,,,....{{{{{,.,|{{{{{{{{{,.,,,||,...{{{{..,{((((.(,,||||({{{{{{{.,.|||||}||}},.{((((......))))).,})|))})},,))},,||,.{.((.....))|{{{{{{((((......))))}......((((((.{{{(,,,,.|{{,......,}},.)))),))))))..((((((..(((({.{((({..,{{{.((((.....)))).........................,((((((((((((((({,{{{{{{{({(({.((,,,...,,.,||||||{{...|||}|}((((,,((......)})}})}.,{|||{{|..,||,,..,|||,..||}}}}}}},||,||}},}..})}}}..,,,,,}})}},},,}}.,,.......}))))),})))))))))}}|..})))}.})))}....))))))(((((((((((((((..(((((((.....)))))))..))))))))))).)))).....}|}}||,,.,,,.((((((.{{{.||||,,.)))},))).)))})}..,,,,,,,||||..||,,,)),.}}}},.,,,}||,,||,((((((((........)))).))))..}}})))),}))}}}..}))},,}})))))))))))})))))))},})))))))...))))))))))}..)).)))))..}))))))).))))}...,((((....)))))}))))))).))))))))............|.}}}},.})}}},}||||}{{{{{,,,,|||,,||,||{{{{|,{||||||||{{{,,,.{{{((({.{{{{|,,..,}}},,.})}}}}|,,.,,||,,}|}}}}}}}}}|,,,,{,|||,|((({.|{.||(((((((((.....))))))))},}|||}))).|,|||,|||||||||}||}}||}}|||}||||||,........{(({((((|....|,}))}}}}},...}}}}|||||},}||{||||||.||.|||||,..,,,|||{{{{{,{{{((((((((((((((,.,,...,{((({((.{{((({..,{{{{{{{|,,{,(((((,{{({..,((,........||,{||}||,,,||}}}|,,}}}}|||{|,,.||||}||||||}}|(((((....)))))},,.,|||||||,,..||}|||||||||||||||||,||||..}},}}}||,.,,...||}}|||}}||||{|||}.||||}},.{,,,..||||||},..|{{|{{.|||||||}}}......{(((((....{|}|||{.,{{{{,,.,,,,..(({.{(((....)))}.})).||}}}}||.||||,}|((({{{(({{{{{...,,|||||||(((((.((({....}))).))))}..........{{{{...,,.,}}}|{,,..{{{{{.,..{(({{|,,|,}}}}}|.,|,||}}}..}}}((((((........)))))}..,,,||||,((((((((.,,....(((((({(,,,,..........}},)))))))).,,,{{,.{((({{{..,,)}}}))|{||.,,..(((((((((({.(((..(((((...((((((.,,........,,...))))))...)))))..))).,.,.}))))).))))...,,})},..,,}},.)))))))),||||||{{{{.{((({,{(((,({(({{{{{,.({,{({(((((({....}))))))))),}}..........,,..,{{,,..,|,|((((({{(((,,,.{{,.,{{,,...,,,}}{{{{{{{|{||},||...,{{|||{|||||{{,|||||,{{,{.||||{{,|,||||{{{.{{{(({{.{(({{{,|{{{|.||,,.|||{(((..{{{{...,{{{,,,......|.(((((....)))))|||..((((((((((...((((....))}}.,,..)))))))))).}}}.....((((((({..((((((....))))))})))))))...,,,,,.{||......},,..}))|,.)))})))},||,.{((((((.....))))))}{{{{{{{,.,,{(({{{.,||||{{,({{(({{.(((,.....,,..{{{{{{{...{((((((.....)))))))..,{{,{||||,...,,,,.....(((......)))}}||||||}},|||||||,||(((({((({(({{,,{|}}}||,,,|||||||{(({{{{{{..........((((((((............))))))))....(((((((((({{...}),})))))))))..,|}||||}...)}),|||||.,|||||,{{{||.,...,,.........,)),},|||||||||.{(((({......}))))}.,||||||}..,.,|||,(((((({...}))))))....{{{{{,,.,{{{{(({({(({{(({((({..,{{{{{{..,,,,|,....,,....,,,{,{{{{{{((((({,......,,{.{||||||||,,,}}|,,|}|}))),}}}|..{(({(({(({((((,((...,,,,,,,..,,,,.,{{,,....,|}.|}|,|||}},.,||))|,.....{(((((((((...}))))))))).,,|},,,.{{{......)}}.(((.(((((.,(((((,,..,,{,.....{{(((((...{,...,)...}))))..)}.....},,)),}))),,.))))).)))..........,}},,))))).}}))}},,.})))))))))))))|}}||}}}||||||{{{{|{{|||||||||{{{{{{{...,.,...{{{{(((,,.....(((,,,....,}}...,,,,.}}))))||||||||.|||||,..,,|.|,|||||||||,,,||,......||||}}||,............,|||{{|||||||,..........,,{{|||||||,||||{({(,,..,,,,,((((({,|(((({{((,,.{(((({,{{{,,|,,........,.......|,(((((....(((((.....)))))....))))),.,..,,||.......,.{{(((((((......)))))}|}))|,{{{..,{(({{.,,,{,(((((....}}}}}....,|||||,,,,|}}}}}}}|}}}}}}}}}...,}}}}|.......,,,...,{{,...,,||..,}}}.,}||||{{{|||,..,,},||{||,|||.,||}}.|}}))}||}},}}|||,,.,,,,.,,,,,|||,,||||,,(({..{{|||...,,......))}}}.,|||,..{,{{{,{{.,(((||||{{,,({..{{{,.....|||||,....,},{||{{|{{.{{..,{,.................,}..,,...,)),})))))))..},||||||,||||}}||,.{|||||||{|||,||||,}||||,...,{,,.,{{,,,.....,.....,..|}}}|.||||,|||,,.,|||,.},,,,,..........(((((((..............(((((.((........)).)))))..(((((((((.......(((((((.,.....,,.)))))))((((((((..((((((.........))))))..))))))))..))))))))),{{|(({,,..,,...,},,}}}...,}{||,,..)}}..................((((.((((((.((((...((((...(((((((.(((((((((.,........)))..)))))))))))))..{(((......)))|(((.((((((((.....(((((..(((((....((((,......((((((({{,{|||,,,{{{{({(((......}}))|.,,.,}}},}|||,...,,.}))},.}}}}}..,||}|{(({{,.....,,))))).,{{{||.{{{.,...,}}}),))}}},,,))))}}}}}((((((...........)))))}{((((((........)))))))))))....)))))..))))))))))))).)))}............((((({......)))))),{((........}}}}.,((((((............)))))}.,,.(((((....))))).....)))).)))))))))).)))).))))))).,,,,||,,,,...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))),,}},..,,,...,,}))))))....,,,||{|{|||,...}}}}}))}},))},||||||||||,}}||||,|,...,,...||||,..||||||||||.......(((((((((.{((.....((({.{...((((((......))))))....},))))....))}..)))))))))..((({.,{{{{,,,)}}}|{|||||||||||,||||,}})}||.,,.,,{{{{.((((((..(((({.(((.(((....,,,.}.))).)))))..))))))}}}},....((((((......))))))....{{{{........}}))......(((({{(((((({......{{......},..,,....,....{{(||....))).............(((((((.{{.(((((((...,,,,...............,.......................))))...))))).)).}}))))))).......)))))))))))),,}}))}))|||||,|||||.....,....,,,,,|||,....}},}.,,||||||...{{{{{.,||{....})}.,))}}}.,,,.|,,..,,}))))}}}}}}}...,,,((((,.((.{((((({{.|{{...|,.{{((...........)))}..,...}}}..)))))))).)),.)}))....{((((,,,.,.......))))}.}}},,}}}}},..,}}},,,}}}.}))}}}},....,.((({{..{{{{{{{..,,)))))))))))))))))))}))}),}},....,,},))))))))}.))))}..,,,,.|{||{|.|{||{{,......,,.,,,,,...,,....,,,,,.,,,,}}}}}}}.}}}}}},|}})))}})))},|{{{.....}}},.....,}},,,,,,...........{{{|....,,...,.,,.,}}}},.||{..(((((........)))))..},,,,}})}}}}||{{|{{{{........,,....,,,,)))))},..,,,........}}},}},,,,.{||..,....,..)})}}}.,)))})}).},,..{{(((({........)))))})...,.........{(({.....))))....,}|||......}},))))}})))}}))))})))))))))})))))))),}}},...........,,,}},})),,,})))}))))))))}.......((((..{{.{((({....})))}.))..))))......,.},,}}}....}}))}},.,,,,.,.,,,...}}}}}|,|||}||((((....{(((((..{{{{{{.(({{......}))).)))...}}}.,.))))))....))))}}}}}}.}}}}}}},,,|||,,..,,),,},}}}}}}||}.,{(({(.{{((((((.,(((..,{|......,,,,||..{{|.|,,,.....,|},........,....,{{{{....||}||,,{|||,|||}||....||,|}|,,|}}|,|}}}}}...,}.,...{(((((,{{,,,{,.....,,,,||.....,,.,,,,.......))))|||||||||}}}}}}}))))),)))))}}|}}}..,,...,||||}|..,,}},,)))))),.)))}...}})))))))))},.,}}},,,,.,,}})},,,||||,.(((((.,({(((.(((.....((((,{((........)))))))....))).,))))}.)))))..,,,}}},}})}},}}}},.,||...||{{|,,,||{{..{,.....}}.,))}}...))))),}}}.}|||.|,,}}||||,}|,||||||,.......}}}}|.|,|}}}|||,,..,,..,,((((((((((.((..,,,............}}.))))))))))))....,,...{{{{.((((((((((....)))))))))).))},.{((,,{,.((((...)))).,}..}))|}))))))))))}.{(((((({.....,))))))),(((({,.,..|{((({........))}}}},))))}.||{,.,.(((((((...))))))),,,({(((,..{{....}},.}}))}.}}.,},,..{((((((((((.....{,....,},))))))))))}...)))))))))))))))))))}}.,.)))},..,).))))))))){((((((.....))))))}..(((({...}))))..)))))..))))).....))))))...)}).,.||,...(((((((((..,{,{((({.......(((....))).......})))))..)))))))))}},.,,,.}},,,}}}}))))),}))...,.....((((.((.((((.((.........)).)))).)).)))).....((((..((((({....}))))).,..)))).,,{...((((......))))...,,,,..........((((((.((((...((((({{,,{((({{{{{,,{{,((((((((.....,,.....,,....)))))))).,,||.||{{{{,{(((((((...,.(((..,,.....,...))).}...}))))))))))}}}}||||||{{||,||,,{(({.,,,{||}|,,||},,,,.{||{{{{{,,,,,,}}}})))),|||||((({{(.(((((((....))))))).)))))(((((((((((.{(((((({.....,,,....,,,{(((,.(((.((((((,.{{....}),.).))))).))}.},}))}(((((((((((((((({...,{..((((((((((..(({.{{{.....,.....})),)))....))))))))))...||..,,,,,{{...,..,(((({{.......,.,}}}|||,}},,{{|.......,|,....}}}}}...{(((((.({((({..((((((((((................)))))))))).})))....}).)))))).,{{{{{((((((((({.,.......,.}))))))))).|{|||}},,,.,|,|}}}}..}|}.||{{{...,}}},....,,(({({..,((((....)))}...,..)))))..{{.((((((..........))))))))((((((((((.,.{(.(((({..,.....,,.))))).)).,))))))))))......))))))).........))))))))))...,{{{.(((((((......))))))}....}},))))))))....))))))))))).,{{{((({{{|,,,,,,....,,}}}}|}|...||||,{|||,..,,,,|.|||||,,,,,|{{,...}}}})},))))))))}))},,,,|,,...)),.))))).))))...)))))))))))))))).(((((..,....,..)))))....{((((({((((..{{{,,.,,,,...((((((..(((((((..(({{{,......{{....}).....}}..))}})))))))....))))))........))))),.}.,}),,))))))))))).)))))}..{(((((((.......)))))))}.)).)))))))))))))...)))..)))))...))))))))))))).,.})))).}))))..(((((((((....)).)))..)))),...))))))}}.)))))).((((((({.,,...,|||{||||||,..........{,{,,,...,,,.}))))}),.....||,||},||}|}|||||||},|||}|{{{{|||{.,.,,,|},,}}}},.,|,|....,,,.......................,},|||||||.((({{{{(((,((((.,,,,((((((((((..(((((({{..((((((((((({....}))..)))))))))....{{((((((.....})))))}|,.{(,((,{{{{{((((....,,,,,.{((((....}))))..,,,,,,.,}}}}}}})))}}.}))))))}}}......})))},},,}}}}))).)))),,,,,..}}}..,,,.,,}}}})))}.,,,.,,..,,,}},,,,,,|||||{{{,{{{((({{{,,.,||,..}}}},}},,}}}}}},,,}}.})))|||},,.{(({{{.....,,,|,.,||||},..,}}||,.......,},}..)))))).,))))),..,)))))}},,,,|},|{{{.((((((......,{(((((((....))))))))......)))))).)))},}},,})),}..,,))}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001365933.2 NCBI
CGAGGAGUGCACCCAGAAUCCAAAAAAGAUUUUUUAAAAAAGAAAGAAA… 16462 nt 0.3353
NM_001365934.2 NCBI
CGAGGAGUGCACCCAGAAUCCAAAAAAGAUUUUUUAAAAAAGAAAGAAA… 16435 nt 0.3351
NM_001365935.2 NCBI
GCCGCGGCUGUAAGCCGAGGAUCAGGCGGCGGCGCGGAGAGCGCGCCCG… 16154 nt 0.3389
NM_001365936.2 NCBI
AGACUCCUGCACCCGACAACGCCACGGAGUGAGGGGAGAGGGAGAGAGA… 16578 nt 0.3387
NM_014932.5 NCBI
GCCGCGGCUGUAAGCCGAGGAUCAGGCGGCGGCGCGGAGAGCGCGCCCG… 16674 nt 0.3441
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary

This gene encodes a member of a family of neuronal cell surface proteins. Members of this family may act as splice site-specific ligands for beta-neurexins and may be involved in the formation and remodeling of central nervous system synapses. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that repeated-intermittent methamphetamine (METH) exposure significantly reduced Nlgn1 protein and mRNA expression in the nucleus accumbens, and this reduction was modulated by miR-128, where inhibition of the NLGN1 increased Nlgn1 expression while its over-expression decreased it in saline-treated mice [Li et al. DOI:10.1111/adb.12881].