Basic Information

Symbol
NLRX1
RNA class
mRNA
Alias
NLR Family Member X1 CLR11.3 NOD9 Nucleotide-Binding Oligomerization Domain, Leucine Rich Repeat Containing X1 Nucleotide-Binding Oligomerization Domain Protein 5 Nucleotide-Binding Oligomerization Domain Protein 9 Caterpiller Protein 11.3 NOD-Like Receptor X1 NOD5 Nucleotide-Binding Oligomerization Domain Protein 26 NLR Family, X1 DLNB26 NOD26
Location (GRCh38)
11:119166481-119184017
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001282144.2
Sequence length
4131.0 nt
GC content
0.6265

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1845.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1913.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1248.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282143.2 NCBI
AGUGCCCGCGGGGAUGGAGGCAGGGAGGGGGGACGAUGGCGGGACGGGU… 3723 nt 0.6154
NM_001282144.2 NCBI
AGUGCCCGCGGGGAUGGAGGCAGGGAGGGGGGACGAUGGCGGGACGGGU… 4131 nt 0.6265
NM_001282358.2 NCBI
CUUCUUUCUUAACCAAGGUUACCAGCAGCCACACACAUAGGUCUGGGCU… 3667 nt 0.6054
NM_024618.4 NCBI
AGUGCCCGCGGGGAUGGAGGCAGGGAGGGGGGACGAUGGCGGGACGGGU… 3750 nt 0.6171
NM_170722.2 NCBI
AGUGCCCGCGGGGAUGGAGGCAGGGAGGGGGGACGAUGGCGGGACGGGU… 3047 nt 0.6259
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the NLR family and localizes to the outer mitochondrial membrane. The encoded protein is a regulator of mitochondrial antivirus responses. Three transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the lncRNA NKILA, which is downregulated after traumatic brain injury, exerts a neuroprotective effect by competitively binding to miR-195 to prevent neuronal injury through the upregulation of NLRX1 [Li et al. DOI:10.1016/j.neuint.2023.105643].