Basic Information

Symbol
NMI
RNA class
mRNA
Alias
N-Myc And STAT Interactor N-Myc-Interactor N-Myc (And STAT) Interactor Nmi
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_004688.3
Sequence length
1229.0 nt
GC content
0.3808

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-272.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -301.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 328.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((((.((((...)))).)))).)))).)))))(((((.(..(((.(((...))))))...).))))).(((.(((..(((....((((...............))))....))).....)))))).............(((((((((((..((((((..((((............(((.....)))..........((....)).....((((.(((...))).)))).(((((((.......((((((((....((((...))))......((((......)))).(((.(((((((.(..((((.(((((......)))))....))))..)...))))))).)))(((.(.....(((((.(........).)))))).))).((((((((.(((((..((.......))..)))))..))))))))(((((.......)))))((((.........)))))))))))))))...))))((((((((((........(((((((((((.(..((..(((((.((((....))))..)))))......))..)))))..)))))))(((.....))).......................)))))).)))).))))))))))......((((((((((((((((..(((((((.....((((..((((((((..(.(((((.((((....)))).))))).)(((((......(((((..(.(((((..........))))).)..)))))......)))))...((((....(((((((((............((((((((.((.....)).))))))))..(((((((((((......))))).....(((((.....)))))...)))))).......)))))))))......))))...((((((((............))))))))(((((((...((((((...(((((((.((((((.......((.((....)).)).......))))))..)))).)))....)))))))))))))..)))))))).))))(((((..((..((((((......(.(((((.((....)).))))))....))))))..))..))))).(((......))).........))))))).))))...))))))))))))..(((((((.((.((((.........)))).)))))))))........))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((((((((((.((({...,))).))))}}))).))))}{(((({{,,((({(,{{{.|||,}}...),)}))).{((,,({..{{{,.,.{{({,..............)))}..,.})).}}}.}},},}.............(((((((((((((((((((..{({,.,.,.,,.............|||,........,{(({.{{,....{(((((({(((((((.{{,..{{,,....{((((((.((..{,....((({...))))......,}..)).})))))).|||}})}.}})))).{{{{.(((((,....})))))....))))..,..,))))))))))}.})),..)))))))))}..............{{{.(((((((((((((((((((((((((((((.((((....((((((,.((((((.......)))))).(((((...........))))).{((((.((((((..((((((((,,.....(((((((((((.,..,,{{(((((.((((....))))..)))}),,}}..,}...))))..))))))){{({..((((((.{{{,........,,,......,,{{...||||{((...{((((.....)).}||,}}}}}}|{.{{,.(.((((((.{.....,.)))))).}.)).),))).)))))).))))),})))))..))))))....(((((..{.(((((..{.......))))).,..))))).))))))))))))))).))}((((((........))))))..((((....))))..........(((((((((((..{{{(({....((..(((((((.(((((((.(((((((....)))))..,,,,,{(({(((,,{,,......,.{{({{{{{{{.,.......}.,))|}|||}|{((({(...((({{{...{{{{{{{,|{{{{{..,,||.||.((,,,,}|.}}..,..,,}}}}}},,||||{|,},,..}},}},}}))))}.,,,,,|}},.})}},,}}}))),.,,.....},,}}}}},.,}},.,,{{{{.{{{|...,}}},))))),)).))))))).))}}})))..))...))}.,}}..))))))))))))))))))}.})))))).)))).....{{{........}},))))))))..}}}........,}))))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUUUCAGGCGCUGCUGUUUUCCGGGAAGGGCAGGCGCGCUGGGCCUUGG… 1229 nt 0.3808
Summary

NMYC interactor (NMI) encodes a protein that interacts with NMYC and CMYC (two members of the oncogene Myc family), and other transcription factors containing a Zip, HLH, or HLH-Zip motif. The NMI protein also interacts with all STATs except STAT2 and augments STAT-mediated transcription in response to cytokines IL2 and IFN-gamma. The NMI mRNA has low expression levels in all human fetal and adult tissues tested except brain and has high expression in cancer cell line-myeloid leukemias. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.