Basic Information

Symbol
NOG
RNA class
mRNA
Alias
Noggin Symphalangism 1 (Proximal) SYNS1 SYM1 Synostoses (Multiple) Syndrome 1 SYNS1A
Location (GRCh38)
17:56593699-56595611
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005450.6
Sequence length
1913.0 nt
GC content
0.5917

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-818.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -849.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 481.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((....((((((((((...(((((.(((((.((.((((((((((((((((....((((((((.(..((((((.(((((((.((((.....(((((.......((((..(...((((((((.....)))).))))...)..))))......))).))..((((((((...((((.((.(((((..(.((..(((((((..(((((((((((((((..((((((((.....)))))..((((((((.((((.(((........)))))))..))))))))(((((((.........))).))))......)))...))))).)))))...)))))..)))))))..)))))))))).))))...))))))))((((((....))))))..)))).))))))))).((.(((......(((((((((((......((((((((((.(((.(((...)))))).)))))))))))))))))..))))..))).)).((((((((((((((.((((((.(((.(((((.(..(((((......)))))..).))))).))))))))))))..)))))))))))))))..)..)))))))).............(((...(((((...((.((((((..((.((((((((((.(((.((............((((.(((.((((((....))))))..))).))))..((((.(((....))))))).(.((((((((......(((....((((....))))...))).)))))))).)..)).))).))))))))))..))..)))))).))))))))))))))))))).))...))))).)).))))).))))).(((..((((((.(((..(.((((...............)))))...))).))))))..)))..(((((((((((((..((.(.(((.((((.........((((.(((((((((((((((((...)))))((((((.....)))).))...))))...)))))))).)))).))))))).).))....))))).)))))))).....(((((.((((.(((((((....))))))).)))).)).)))....)))))))))).....(((((((.(((.((((((....))))))((((((((((......))))).))))))))))))))).........((((((.(.(((......))).).))))))((((.....))))))).))))....((((((....(((.(((...((((((((..((((..(((((((.......((((((....))))))....(((((.(((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((.((((.........)))).))))).(((((.((...)).)))))(((.((((((((......)))))))).)))..........((((((.(((((((..(((((..(..((.(((...))).))..)..)))))..)))))))....))))))))...))))))))))))))).)))))))))))))..))))))))))))..((...............)).............((((.....))))))))..)))))))).............((((((........))))))))))))..(((((...((((.((.....(((((((((((((.......))))))).....))))))....)).))))..))))).......((((..(((...((((((.....)))))).)))..))))...((.(((((....))))).))........((.(((((..(((.((((((((.((((...)))).)))...))))).)))..)))))))..))))))...................
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((({{....(((((((({({{,(((((,(((((.((,((((((({((((((((....((({{{((,(,.((((((.(((((((.((((.....(((((.......((((..{...((((((((.....))))}})))...}..)))).|....}}}.}|,,{(({({{{..|||,|,|,}||(({,,({((,,(((((((,.((((((((({(((((..((((((((.....)))))..((((((((.((((.(((........)))))))..))))))))(((((((.,.....,.))).))))......)))...))))).}))))},.}})))..))))))),.})))))))})}))),.,})))))))|((((((....))))))|,)))).))))))))).((.(({,,,...((((((((((,.....,{(((((((((.(((,{({..,)))))).)))))))))))))))))..))))..})}.)).(((((((((((,,({((((((.(((.(((((.(.,(((((......))))},,},))))).)))))))))}))..)))))))))))))))..)..}))))))){||,,,,....,,{{{,..(((,(({{{(.((((((..((.((((((((((.(((.((............((((.(((.((((((....))))))..))).))))..((((.(((....))))))).{.((((((((......(((....((((....))))...))).)))))))).}..)).))).))))))))))..))..)))))),})}})).)))}})))}))},)),,.))})},||.}}})),))))),{{{.,((((({.(((..{,({{{.,...,,,,,..,|,||}},..,))),)))))).,|||..(((((((((((((..((.{.(((.((((.........((((.(((((((((((((((((...)))))((((((.....)))).))...))))...)))))))).)))).))))))).}.))....))))).)))))))).....{,(((.((((.(((((((....))))))).)))).)))}))}}..}))))}||||,....|||||{|,||||||||||...|))))))(((((((.||,.,},,(((((({....))))))).,,........,((((((.{.{{{,.....))}.,.))))))||||}}}}.))))))}}}}}},,..,,,.{{{.,,{{{.,||.,.((((((((..((((..(((((((.......((((((....))))))....,{{{{.(((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((.((((.,,....,,)))).))))).(((((.{{...}}.)))))(((.((((((((......)))))))).)))..........{(((((.(((((((..(((((..,..((.{(,...,)).))..}..)))))..))))))}....))))))))...))))))))))))))).)))))))))))))..}}}},)))))))..,,.......||......|,.,,.....,..,.{(((.....)))}))))..)))))))),,,,,,...||||((((((....,,,.}}}},|||||}||{((({{{{{(,,..{{{|.,.{{(((.(((((((.......))))))))))}|((((({{.,{||,||,..,}}..,}}}},}}||||..{,,...((((((,...,))))))||||,,|||},,{(({{({((....}}}}}.,........,||.{{{{|,,|||.||||||||,,{,|,,,))}).)))...))))),))),,)))))))}}).}},,.},}}}}),.....}))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005450.6 NCBI
AAACCGGUGCCAACGUGCGCGGACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCUGGAG… 1913 nt 0.5917
Summary

The secreted polypeptide, encoded by this gene, binds and inactivates members of the transforming growth factor-beta (TGF-beta) superfamily signaling proteins, such as bone morphogenetic protein-4 (BMP4). By diffusing through extracellular matrices more efficiently than members of the TGF-beta superfamily, this protein may have a principal role in creating morphogenic gradients. The protein appears to have pleiotropic effect, both early in development as well as in later stages. It was originally isolated from Xenopus based on its ability to restore normal dorsal-ventral body axis in embryos that had been artificially ventralized by UV treatment. The results of the mouse knockout of the ortholog suggest that it is involved in numerous developmental processes, such as neural tube fusion and joint formation. Recently, several dominant human NOG mutations in unrelated families with proximal symphalangism (SYM1) and multiple synostoses syndrome (SYNS1) were identified; both SYM1 and SYNS1 have multiple joint fusion as their principal feature, and map to the same region (17q22) as this gene. All of these mutations altered evolutionarily conserved amino acid residues. The amino acid sequence of this human gene is highly homologous to that of Xenopus, rat and mouse. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NOG was identified as a high-confidence gene common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption in postmortem prefrontal cortex [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].