Basic Information

Symbol
NOL8
RNA class
mRNA
Alias
Nucleolar Protein 8 C9orf34 Nop132 Nucleolar Protein Nop132 FLJ20736 Chromosome 9 Open Reading Frame 34 BA62C3.3 BA62C3.4 NOP132
Location (GRCh38)
9:92297358-92325636
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017948.6
Sequence length
4075.0 nt
GC content
0.4052

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1052.37 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1123.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 965.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256394.2 NCBI
AGAAGUUAGGGGCUGCAGCGGCGCUGGCUUUAGAAAAUUACUUUUCCCA… 4179 nt 0.4056
NM_001330722.2 NCBI
AGAAGUUAGGGGCUGCAGCGGCGCUGGCUUUAGGUGAACGACGUGAAAA… 3961 nt 0.4024
NM_017948.6 NCBI
AGAAGUUAGGGGCUGCAGCGGCGCUGGCUUUAGGUGAACGACGUGAAAA… 4075 nt 0.4052
Summary

NOL8 binds Ras-related GTP-binding proteins (see MIM 608267) and plays a role in cell growth (Sekiguchi et al., 2004 [PubMed 14660641]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

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