Basic Information

Symbol
NOP53
RNA class
mRNA
Alias
NOP53 Ribosome Biogenesis Factor PICT-1 PICT1 GLTSCR2 Glioma Tumor Suppressor Candidate Region Gene 2 Protein Protein Interacting With Carboxyl Terminus 1 Ribosome Biogenesis Protein NOP53 P60 Glioma Tumor Suppressor Candidate Region Gene 2 GLT
Location (GRCh38)
19:47745520-47757058
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015710.5
Sequence length
1504.0 nt
GC content
0.6423

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-647.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -672.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 570.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015710.5 NCBI
CUUCCUUUGACAAGAUGGCGGCAGGAGGCAGUGGCGUUGGUGGGAAGCG… 1504 nt 0.6423
Summary

Enables 5S rRNA binding activity; identical protein binding activity; and p53 binding activity. Involved in several processes, including mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling; regulation of intracellular signal transduction; and regulation of primary metabolic process. Located in cytosol; nuclear lumen; and rDNA heterochromatin. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NOP53 was upregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term (0-5 month) weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].