Basic Information

Symbol
NOTCH2
RNA class
mRNA
Alias
Notch Receptor 2 Notch 2 Neurogenic Locus Notch Homolog Protein 2 HN2 Notch (Drosophila) Homolog 2 Notch Homolog 2 (Drosophila) Notch Homolog 2 HJCYS AGS2
Location (GRCh38)
1:119911553-120100779
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024408.4
Sequence length
11425.0 nt
GC content
0.4944

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3908.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4116.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3204.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001200001.2 NCBI
AGGCUGCUUCGUUGCACACCCGAGAAAGUUUCAGCCAAACUUCGGGCGG… 4270 nt 0.5136
NM_024408.4 NCBI
AGGCUGCUUCGUUGCACACCCGAGAAAGUUUCAGCCAAACUUCGGGCGG… 11425 nt 0.4944
Summary

This gene encodes a member of the Notch family. Members of this Type 1 transmembrane protein family share structural characteristics including an extracellular domain consisting of multiple epidermal growth factor-like (EGF) repeats, and an intracellular domain consisting of multiple, different domain types. Notch family members play a role in a variety of developmental processes by controlling cell fate decisions. The Notch signaling network is an evolutionarily conserved intercellular signaling pathway which regulates interactions between physically adjacent cells. In Drosophilia, notch interaction with its cell-bound ligands (delta, serrate) establishes an intercellular signaling pathway that plays a key role in development. Homologues of the notch-ligands have also been identified in human, but precise interactions between these ligands and the human notch homologues remain to be determined. This protein is cleaved in the trans-Golgi network, and presented on the cell surface as a heterodimer. This protein functions as a receptor for membrane bound ligands, and may play a role in vascular, renal and hepatic development. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011] CIViC Summary for NOTCH2 Gene

Forensic Context

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