Basic Information

Symbol
NOTCH3
RNA class
mRNA
Alias
Notch Receptor 3 Notch 3 CASIL Neurogenic Locus Notch Homolog Protein 3 CADASIL Notch (Drosophila) Homolog 3 Notch Homolog 3 (Drosophila) Notch Homolog 3 CADASIL1 CARASIL1 FPLD1 IMF2 LMNS
Location (GRCh38)
19:15159038-15200996
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000435.3
Sequence length
8680.0 nt
GC content
0.6305

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3942.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4080.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2729.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000435.3 NCBI
CUUCGGCGAAGUUGGCGGCGCGGAGGCUGGCCCGGGACGCGCCCGGAGC… 8680 nt 0.6305
Summary

This gene encodes the third discovered human homologue of the Drosophilia melanogaster type I membrane protein notch. In Drosophilia, notch interaction with its cell-bound ligands (delta, serrate) establishes an intercellular signalling pathway that plays a key role in neural development. Homologues of the notch-ligands have also been identified in human, but precise interactions between these ligands and the human notch homologues remains to be determined. Mutations in NOTCH3 have been identified as the underlying cause of cerebral autosomal dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy (CADASIL). [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for NOTCH3 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.