Basic Information

Symbol
NOXO1
RNA class
mRNA
Alias
NADPH Oxidase Organizer 1 SH3PXD5 P41NOXA P41NOXB P41NOXC SNX28 SH3 And PX Domain-Containing Protein 5 NADPH Oxidase Regulatory Protein Nox-Organizing Protein 1 Nox Organizer 1 P41NOX Regulatory Protein P41NOX
Location (GRCh38)
16:1978912-1984636
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_172167.3
Sequence length
1541.0 nt
GC content
0.6768

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-752.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -778.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001267721.2 NCBI
AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1553 nt 0.6780
NM_144603.4 NCBI
AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1538 nt 0.6775
NM_172167.3 NCBI
AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1541 nt 0.6768
NM_172168.3 NCBI
AGUCUUGCACGCCUCCAGGGCUGGAAAGCUCAUUCUUCUUCUUCCUCCC… 1556 nt 0.6774
Summary

This gene encodes an NADPH oxidase (NOX) organizer, which positively regulates NOX1 and NOX3. The protein contains a PX domain and two SH3 domains. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.