Basic Information

Symbol
NPNT
RNA class
mRNA
Alias
Nephronectin EGFL6L POEM Preosteoblast EGF-Like Repeat Protein With MAM Domain Protein EGFL6-Like
Location (GRCh38)
4:105894775-106004027
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001033047.3
Sequence length
4561.0 nt
GC content
0.4387

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1351.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1445.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1221.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001033047.3 NCBI
GCGCAGCAGACCUGCUCCGGCCGCGCGCCUCGCCGCUGUCCUCCGGGAG… 4561 nt 0.4387
NM_001184690.2 NCBI
GCGCAGCAGACCUGCUCCGGCCGCGCGCCUCGCCGCUGUCCUCCGGGAG… 4612 nt 0.4391
NM_001184691.2 NCBI
GCGCAGCAGACCUGCUCCGGCCGCGCGCCUCGCCGCUGUCCUCCGGGAG… 4651 nt 0.4408
NM_001184692.2 NCBI
GCGCAGCAGACCUGCUCCGGCCGCGCGCCUCGCCGCUGUCCUCCGGGAG… 4474 nt 0.4394
NM_001184693.2 NCBI
GCGCAGCAGACCUGCUCCGGCCGCGCGCCUCGCCGCUGUCCUCCGGGAG… 4564 nt 0.4415
Summary

Predicted to enable integrin binding activity. Predicted to be involved in several processes, including cell-cell adhesion mediated by integrin; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; and positive regulation of alkaline phosphatase activity. Predicted to act upstream of or within positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway. Located in collagen-containing extracellular matrix and extracellular exosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

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