Basic Information

Symbol
NPR2
RNA class
mRNA
Alias
Natriuretic Peptide Receptor 2 GC-B GUCY2B ANPRB ANPb Atrial Natriuretic Peptide Receptor Type B Atrial Natriuretic Peptide Receptor 2 Guanylate Cyclase 2B Guanylate Cyclase B Guanylyl Cyclase B EC 4.6.1.2 AMDM NPRB Natriuretic Peptide Receptor B/Guanylate Cyclase B (Atrionatriuretic Peptide Receptor B) Atrial Natriuretic Peptide B-Type Receptor Acromesomelic Dysplasia, Maroteaux Type Atrionatriuretic Peptide Receptor B Natriuretic Peptide Receptor B ANPR-B GUC2B NPRBi ANP-B NPR-B AMD1 ECDM SNSK GCB
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_003995.4
Sequence length
4248.0 nt
GC content
0.5678

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1605.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1680.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 997.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((.(((((((..((((.(..(.......)..).))))))))))))))))....)))((((..(((.....)))((((.(((((((((((((((((((..(((((((......)))(((((.((((((.(((...((((((((.((((((.(((((((...((((((((...(((.((((((.....((((.((((........)))).)))).....)))))).)))..(((((.(((....))))))))..))))))))))))).)))))).(((....))))))))))))).(((((((((....(((....))).....)))).)))))..................))).))))))..)))))...))))))))))))))))).(((...((((((((((...((((.((((((((((((((....(((((((((((((((((..........((.(((((.(.(((((...((((((((((((..........(((((...........)).))).(((......(((.((((((((((..(((((....(((((...(((....((...(((((((((.(((((((.((..(((.(.(((((((....(((((((.......((.(((((((.......((((((......((..((((.((......(((..(((((...((((((((((.((...(((((((((..((((((..(((((...(..(((((((((.(((((((.(((((((.(((((((((((((((((.((((...))))..)))))))))).))......(((.((.(((((((((((.......).)))))))))))))))(((((....((((((((...))))))))..)))))...((((((((...))))))))........(((((....(((((((((((.((.((((((.((((..(((((((((..(.(((((.(((.(((.((.((((...))))((((.(((((.((..((((((........((((((((((.(((.((((..((..(((.(((...))).)))))..))))))).(((((.(((((..((((((....))))))..))))).).))))...((.(((.....)))..)).............))))))))))...)))))).))((((.((.((((((((((((.(((......))).)))))....(((((((((((.((((((((.......((((((......)).)))).((((((...))))))((((((.(((....))).))))))(((((((((((.(..(((((((((((.....((((...................))))..))))))))...)))..).)))))))))))...))))))))....)))))).)))))...))).)))).)).))))...)))))))))(((...((((((((((..((((..(.((((((((((((.(((....))).))))).))))))))..)))).....)))))(((((((((......((....)).......)))))))))....)))))....)))((((...)))))).)))))))))))))))))))))((((....)))).))....)).))))))))..))))))))))).)))))...)))))..)))........)).))..)))...)))).))))))...((((((...))))))....)))..).)))))..))..)))).)))))))))....)).)))).)))))).........(((((...)))))))))).))).....)).))))..)).((.....)).....(((((.((......)).))))))))))).....))))))).)).(((((..(((((.......)))))...)))))......))).)))).))))))).).)))..)).))))......))).))).))))))...)).......)))...)))))....)))))..)))).......)))))).)))........)))))))))))))..))...)).)))))))))))..........)))))..))))))(((......)))..((((((.(((((((((((.....((((.((((....((((....((.((((...((...(((((...((((.(....).))))((((.((((............)))).))))((((.(((...(((((...(((....))))))))))))))).)))))..))..)))).))..)))))))).....(((.((((....)))))))..))))....)))))))))))(((((.((........)).)))))))))))((.((((.((((((...((((.(((((.(((......((((((((..(((....(((((((.((((((.(........((((..........))))........).).))))).))).))))(((...))).(((((((..(((((.......))))).)))))))(((...((.((((((((((((((((((((..((...(((((.....(((..((((((((((((((((.(((....)))...))))..))))).))....))))))))....(((((..(((.....((((((.........))))))........((((((((((..((.((.....(((((....(((((((((((((((.........))))...)))))))))))(((((((((((....))))))....)))))((((...)))).............))))).....)).))..)))))))))))))..)))))(((((((((((.(((......((((.....(((...))).((((.......)))).))))..)))....))))))))))))))))...)).))))))...((((.((((((((((((((..(((.(((.(.((((.((.....))))))).))))))((((((....)).))))...(((((((((((........))))..))..))))))))))..))))..))))).))))....)))))))))))))))).)))((((((.......))))))))).))).))))).....))).))))))))).))).))).))))..)).))))))(((((((.((((((.((((.((((((...))).)))...)).))))))))..........)))))))))))))).......))))....))).))))...)))..))))))))))(((((((.(((.................))).)))))))......(((((((.((((((((((((((((....((((.((((........))))))))(((((.(((((......))))).)))))((((((.((.....((.(((((((...(((..((.....))..))).)))))))..))....((....))((((((((.((((....(((((((.......((((..(((..((((((((((...((.((.(((((((((..(((((....))))).....((((((((((((((..((....))..)))..)).)))))))))((((((((((((.((((.((((((((.....(((....)))..(((((((((((((...))))))..))))))))))))))).)))).....))))).((((((...(((..((.((((..((((....))))..)))).)).)))...))))))(((.....)))...(((((((((((((.........(((.(((((((.....)))))..)).)))(((....)))..)))))))))))))...)))))))...(((((((((......(((.((...(((((((..(......)..)))))))...)).)))......)).))))))).((.((((......))))))..)))..)))))).)).))...))))))))))..)))..).)))....(((...(((((((.....)))))))....))).........))))))))))).)))))))).)).))))))..))))).)))))))).......))).))))))))))))).))))........(((.....)))......(((((....((((((....))))))...))))).................))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,(((((.(((((({.{((((.(..(.......)..).)))))))))))))))),,,.|}|{(({(((.(((((((((((((((.(((.((((((.((((((..((((((({{,{.{|.{({{,,.,{|||}..((.(.((((((((.(.((((.(((((((...((((((((...(((.((((((.,...((((.((((........)))).))))...,.)))))).))),.{{,(((({....}))),,}}}..))))))))))))),)))))).(((....))),,))))))))}})}||||)))}.,{,.....}},...,,}})),))))),..)))))).))}..)))))).)))))).....)))).))))))))||{{{|{||,((({..{(((((((,{.{{((({.{{((((((((((((.,..{{,,,,(((((((((((..........((.(((((.{.(((((..,({((((((((((,..,,.....(((((...........}}.}}),{{{,,....(((.((((((((((..(((((...,({{((,..(((,,.,{({..{{{((({((.((((((({,{..(((.({(((,,,,....|||||,|}}...,{((.(((((((.......((((((.,,...((..((((.((......(((..(((((...((((((((((.((...(((((((((..((({({..(((((...{,.{{{((((((.(((({((.({{{(((.(((((,{((((((((((.((((...))))..)))))))))).},......(((.((.(((((((((((.......),}))))))))))))))(((((....((((((((...))))))))..)))))...((((((((...))))))))........(((((....(((((((((((.((.((((((.((,(,.(((((((((..{.(((((.(((.(((.((,((((...))))((((.(((((.{,..((((((........((((((((((.{,,.,(((,.,,.(((,{(((.{{|.|{,||||..,,,,|||.(((((.(((((..((((((....))))))..))))).).)))).,.)).|||}}.}})),..)),..},},,...,.))))))))))...)))))),}}((((.((.((((((((((((.(((......))).)))))....(((((((((((,(((((((({{{,.,.(({,,,.}}}.))).},},.,(((({...))}))|((((((.(((....))).))))))|((((((((((.{..((((({(((((.....{{{{...({,,,,,...||,,..}}}},,))}}))}}..,))),,}.)))))))))),...,))))))).,..)))))).)))))...))).)))).)).)))),..)))))))))(((...((((((((((,,{(((..{.((((((((((((.(((....))).))))).))))))),..)))).},..))))){{(((((((.,,,..((....})},|....))))))}},....)))))....))){(({...)))))).)))))))))))})))))))))((({....}))).))....)).))))))))..))))))))))).)))))...)))))..)))........)).}}..}}),,,)))).)))))}...((((((...))))))....|||..,.}))))..)}.,))}).)))))))))....)).)))).)))))).........(((((...)))))))))).))).....,).))))..}}.((.....))....,(((((.{{......}}.))))))))))).....))))))).)).,,,{|....}}}),......))))))))}}.}}}....}}}.)},..,)))))),|,|||..}),)))}......))),}||,|||,}}....)},.,,,,))},.,)))))....)))))..)))).......)))))).)))........}))))))))))))..))...)).)))})))))))..........)))))..)))))){((......))}...{{{{{{(((((((({,(...,{({,,..||||{,,(({{....,,.{({{..,,,...,|||,...,|||},,,.})})))))|{,.,,{{.,{{.{{{{{{{||||,|.((((({{(({..,(((((...(((....))))))))))))))))),,))}}}}.,||||{||{{||,||,,|{,{.,(((..({{,{{{||,}}||{,||,,..,.}}}}}|||}||(({{,.||},,,,.,,||||}}||||}}}|{{.{{,,.|||||||,,{|||,||,,{.(((......))}|,,,,}}||||||.,||||{{,|||{{|,|.,.,.,{{{|||}||,,,,,)))))),,)),},,),).)))}},||||||||{{,|,{{{{{{((,,,,}}}}}}...,.(((((({{......}},})))))..((((((((((((({((((((..((...(((((,....(((..((((((((((({,((({((,{{{,,}}..}))))}}))))).))....)))))))},,..,{{{{..{(({||..,,{{||||,......,}}))).,,,{...((((((((((.,.(({{,,...(((((....{((((((((((((((.........)))}...,)))))))))|(((((((((((....)))))}.,,.)))))|(((...)))}.............)))))....,)}.)).,)))))))))),,}.,})))){((((((((((.{{{.{,,..((((...,,(({...}}}.{(((.......)))).))))..}}),}..))))))))))))))))...)).)))))),,,((((.(((({(((((((((..(((.(((.(.(((,{((,...,))))))).))))))((((((....)).))))...(((((((((((........))))..))..))))))))))..))))..})))).)))).,,.}))))))))))))),)))))|{||||},}}}}})))))})))),,...,}}}.,,},,|{{|||||,,,,..))}}))})}}}..))})))))).,(((({.{{{{((.|{,|,||||{{,,.))|,|}}...}),)))}}}},..|||,{{{{|,|||,||{||||.,.,,.{{{{{{.....{({(|,,....||{.{|||||,(({(((((((.(({.................))).)))))))......{(((({{,{{{((((((((((((({{|..,((|(((({{,|....,,,,,,,}|||||,|||||,,....))))}.)))}}((((((.((.....,,.(((((((...(((..((.....))..))).)))))))..,}....,,....}}((((((((.((((....(((((((......,((((..(((..((((((((((...((.((.((((((((,..(((((....))))).....{(((((((((((((..((....))..)))..)).))))))))|((((((((((((.((((.((((((((...,,{{{...,))}..(((((((((((({...})))))..))))))))))))))).)))).....))))).((((((...(((.,((.((((..((((....))))..)))).)).)))...)))))){{{.....}}}...(((((((((((((.........(((.(((((((.....)))))..)).))){((....))}..)))))))))))))...))))))),..(((((((((.{....(((.((.{{{{(((((..(......)..)))))))}..)).)))....,.)),})))))).((.((((......)))))),,)))..)))))).)).))...))))))))))..)))..).))),...(((...(((((((.....)))))))....))).........))))))))))).)))))))).)).)))))),}))))))),)))}}}.....,}})}}))))}})))))))},,,.})))))))}},}}}}}.}}......{{{{{....((((((....})))))...}}}},.................}}})}}..}}}.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGGAGUCGCACUCGGCCGCCGGCGCAGCGAGCGGAGACGGGCCGGGCCG… 4257 nt 0.5675
GGGAGUCGCACUCGGCCGCCGGCGCAGCGAGCGGAGACGGGCCGGGCCG… 4248 nt 0.5678
Summary

This gene encodes natriuretic peptide receptor B, one of two integral membrane receptors for natriuretic peptides. Both NPR1 and NPR2 contain five functional domains: an extracellular ligand-binding domain, a single membrane-spanning region, and intracellularly a protein kinase homology domain, a helical hinge region involved in oligomerization, and a carboxyl-terminal guanylyl cyclase catalytic domain. The protein is the primary receptor for C-type natriuretic peptide (CNP), which upon ligand binding exhibits greatly increased guanylyl cyclase activity. Mutations in this gene are the cause of acromesomelic dysplasia Maroteaux type. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.