Basic Information

Symbol
NPR3
RNA class
mRNA
Alias
Natriuretic Peptide Receptor 3 C5orf23 GUCY2B ANPRC NPRC Natriuretic Peptide Receptor C/Guanylate Cyclase C (Atrionatriuretic Peptide Receptor C) Atrial Natriuretic Peptide Clearance Receptor Atrial Natriuretic Peptide Receptor Type C Atrial Natriuretic Peptide Receptor 3 Atrionatriuretic Peptide Receptor C Guanylate Cyclase C FLJ14054 ANPR-C ANP-C NPR-C Chromosome 5 Open Reading Frame 23 Natriuretic Peptide Receptor C BOMOS
Location (GRCh38)
5:32689070-32791724
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001204375.2
Sequence length
7457.0 nt
GC content
0.4188

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2254.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2392.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1642.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000908.4 NCBI
GGCGCGAAUCAAUGAGAUCAAAUGCGAGGGAGAUGCACCGUCAAUUACA… 7454 nt 0.4187
NM_001204375.2 NCBI
GGCGCGAAUCAAUGAGAUCAAAUGCGAGGGAGAUGCACCGUCAAUUACA… 7457 nt 0.4188
NM_001204376.2 NCBI
ACACCAGGUCCGCGAUGGAGCCAUCUGCACUGGGACCUUGGUCCUUGUU… 6364 nt 0.3925
NM_001363652.2 NCBI
ACACCAGGUCCGCGAUGGAGCCAUCUGCACUGGGACCUUGGUCCUUGUU… 6367 nt 0.3926
NM_001364458.2 NCBI
AGAAGCCGCAUGGAUGAGAACUGAGAUGUUCCAGCUGACCACCCCGGGU… 6294 nt 0.3889
NM_001364460.2 NCBI
ACACCAGGUCCGCGAUGGAGCCAUCUGCACUGGGACCUUGGUCCUUGUU… 6244 nt 0.3898
Summary

This gene encodes one of three natriuretic peptide receptors. Natriutetic peptides are small peptides which regulate blood volume and pressure, pulmonary hypertension, and cardiac function as well as some metabolic and growth processes. The product of this gene encodes a natriuretic peptide receptor responsible for clearing circulating and extracellular natriuretic peptides through endocytosis of the receptor. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Feb 2011]

Forensic Context

A study in human left ventricular biopsies identified the protein-coding gene natriuretic peptide receptor 3 (NPR3) as a neighbor to a novel long noncoding RNA and found it to be significantly up-regulated in both ischemic and dilated cardiomyopathy groups compared to non-failing organ donor controls [Firat et al. DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e13087].