Basic Information

Symbol
NPY2R
RNA class
mRNA
Alias
Neuropeptide Y Receptor Y2 Neuropeptide Y Receptor Type 2 NPY-Y2 Receptor NPY2-R Y2 Receptor
Location (GRCh38)
4:155208636-155217078
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000910.4
Sequence length
3619.0 nt
GC content
0.4161

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1020.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1092.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1064.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000910.4 NCBI
GAGAGACCCUGGACACUGUUCCUGCUCCCUCGCCACCAAAACUUCUCCU… 3619 nt 0.4161
NM_001370180.1 NCBI
GAGAGACCCUGGACACUGUUCCUGCUCCCUCGCCACCAAAACUUCUCCU… 3615 nt 0.4160
NM_001375470.1 NCBI
GUAUUGAGGAACCAUAUUCAUUCAGAUAAAGCCACAGACACGAAUUCUC… 3259 nt 0.3826
Summary

Predicted to enable calcium channel regulator activity and neuropeptide Y receptor activity. Involved in cardiac left ventricle morphogenesis and outflow tract morphogenesis. Located in cilium. Implicated in Huntington's disease; morbid obesity; and obesity. Biomarker of peripheral artery disease and temporal lobe epilepsy. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the NPY2R was identified as a differentially wired gene associated with cell communication in the prefrontal cortex of animals selectively bred for high versus low methamphetamine consumption [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].