Basic Information

Symbol
NQO1
RNA class
mRNA
Alias
NAD(P)H Quinone Dehydrogenase 1 QR1 DTD DT-Diaphorase NMOR1 DHQU DIA4 Diaphorase (NADH/NADPH) (Cytochrome B-5 Reductase) NAD(P)H Dehydrogenase [Quinone] 1 NAD(P)H Dehydrogenase, Quinone 1 NAD(P)H:Quinone Oxidoreductase 1 NAD(P)H-Quinone Oxidoreductase Phylloquinone Reductase Menadione Reductase Quinone Reductase 1 Azoreductase EC 1.6.5.2 NAD(P)H:Quinone Acceptor Oxidoreductase Type 1 NAD(P)H:Menadione Oxidoreductase 1 NAD(P)H:Quinone Oxireductase Dioxin-Inducible 1 Quinone Reductase Diaphorase-4 NMORI
Location (GRCh38)
16:69706996-69726668
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000903.3
Sequence length
2521.0 nt
GC content
0.4383

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-748.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -795.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 476.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000903.3 NCBI
ACACGCGACUCCCACAAGGUUGCAGCCGGAGCCGCCCAGCUCACCGAGA… 2521 nt 0.4383
NM_001025433.2 NCBI
ACACGCGACUCCCACAAGGUUGCAGCCGGAGCCGCCCAGCUCACCGAGA… 2419 nt 0.4349
NM_001025434.2 NCBI
ACACGCGACUCCCACAAGGUUGCAGCCGGAGCCGCCCAGCUCACCGAGA… 2407 nt 0.4346
NM_001286137.2 NCBI
ACACGCGACUCCCACAAGGUUGCAGCCGGAGCCGCCCAGCUCACCGAGA… 2305 nt 0.4308
Summary

This gene is a member of the NAD(P)H dehydrogenase (quinone) family and encodes a cytoplasmic 2-electron reductase. This FAD-binding protein forms homodimers and reduces quinones to hydroquinones. This protein's enzymatic activity prevents the one electron reduction of quinones that results in the production of radical species. Mutations in this gene have been associated with tardive dyskinesia (TD), an increased risk of hematotoxicity after exposure to benzene, and susceptibility to various forms of cancer. Altered expression of this protein has been seen in many tumors and is also associated with Alzheimer's disease (AD). Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for NQO1 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the NQO1 showed a more remarkable effect at a lower paraquat dose (0.02 mg) than a higher dose (0.04 mg) during the initial destructive phase of lung injury, though it did not meet the >2-fold change threshold for a significant marker [Tomita et al. DOI:10.1016/J.Tox.2006.12.005]. In a porcine model of bromine-induced skin burns, the NQO1 was significantly increased at 7 days post-exposure for both 45-second and 8-minute exposures, and it was identified as part of the NRF2-mediated oxidative stress signaling pathway [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007]. In rats, hepatic gene expression profiling following burn injury identified the NQO1 as a significantly altered metabolism gene on day 1 post-injury [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].