Basic Information

Symbol
NR2C1
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Subfamily 2 Group C Member 1 TR2 Orphan Nuclear Receptor TR2 TR2-11 Nuclear Receptor Subfamily 2, Group C, Member 1 TR2 Nuclear Hormone Receptor Testicular Receptor 2
Location (GRCh38)
12:95020229-95073628
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003297.4
Sequence length
4058.0 nt
GC content
0.3802

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1091.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1175.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1020.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001032287.3 NCBI
GUUGCUAAUGCGCAGGCGCUGGCGGGAUAGCGCGCCGCCGAGCCGAGAA… 1860 nt 0.4387
NM_001127362.2 NCBI
GUUGCUAAUGCGCAGGCGCUGGCGGGAUAGCGCGCCGCCGAGCCGAGAA… 2104 nt 0.4263
NM_003297.4 NCBI
GUUGCUAAUGCGCAGGCGCUGGCGGGAUAGCGCGCCGCCGAGCCGAGAA… 4058 nt 0.3802
Summary

This gene encodes a nuclear hormone receptor characterized by a highly conserved DNA binding domain (DBD), a variable hinge region, and a carboxy-terminal ligand binding domain (LBD) that is typical for all members of the steroid/thyroid hormone receptor superfamily. This protein also belongs to a large family of ligand-inducible transcription factors that regulate gene expression by binding to specific DNA sequences within promoters of target genes. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described, but the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.