Basic Information

Symbol
NR2C2
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Subfamily 2 Group C Member 2 TAK1 TR4 Orphan Nuclear Receptor TAK1 Orphan Nuclear Receptor TR4 TR2R1 HTAK1 Nuclear Receptor Subfamily 2, Group C, Member 2 Testicular Nuclear Receptor 4 Nuclear Hormone Receptor TR4 Testicular Receptor 4 Orphan Receptor TR4
Location (GRCh38)
3:14947544-15053600
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001291694.2
Sequence length
8419.0 nt
GC content
0.4534

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2642.89 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2790.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2028.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001291694.2 NCBI
GAACAUUCGCCCUCCUCCUACCAGCGCGCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCA… 8419 nt 0.4534
NM_003298.5 NCBI
GAACAUUCGCCCUCCUCCUACCAGCGCGCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCA… 8476 nt 0.4535
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the nuclear hormone receptor family. Members of this family act as ligand-activated transcription factors and function in many biological processes such as development, cellular differentiation and homeostasis. The activated receptor/ligand complex is translocated to the nucleus where it binds to hormone response elements of target genes. The protein encoded by this gene plays a role in protecting cells from oxidative stress and damage induced by ionizing radiation. The lack of a similar gene in mouse results in growth retardation, severe spinal curvature, subfertility, premature aging, and prostatic intraepithelial neoplasia (PIN) development. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

A study in humans identified 977 differentially expressed genes in blood from myocardial infarction patients, with functional enrichment showing involvement in immune and inflammatory processes [Zhao et al. DOI:10.3892/etm.2017.5580].