Basic Information

Symbol
NR2E1
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Subfamily 2 Group E Member 1 XTLL TLL TLX Protein Tailless Homolog Nuclear Receptor TLX Tailless Nuclear Receptor Subfamily 2, Group E, Member 1 Tailes-Related Receptor HTll Tll
Location (GRCh38)
6:108166022-108188805
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003269.5
Sequence length
3244.0 nt
GC content
0.4932

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1025.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1085.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 793.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286102.1 NCBI
AGAAAUGUUUCGAGCUGGGGCAGAGGGAGCAGAGAAGGAGCCCUCACCG… 2631 nt 0.4656
NM_003269.5 NCBI
AUUCCCCUCCCCGCGGCUGCCUGUCAGAGCGCUUCUGGAGAUAUUACAG… 3244 nt 0.4932
Summary

The protein encoded by this gene is an orphan receptor involved in retinal development. The encoded protein also regulates adult neural stem cell proliferation and may be involved in control of aggressive behavior. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

A study in human burn patients identified the NR2E1 (NR2E1) as one of twelve key immune-related genes significantly up-regulated following injury through differential expression and LASSO regression analysis of GEO datasets [Niu et al. DOI:10.1093/jbcr/irad050].