Basic Information

Symbol
NR2F2
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Subfamily 2 Group F Member 2 COUP Transcription Factor II COUPTFB COUPTF2 TFCOUP2 SVP40 NF-E3 ARP1 Apolipoprotein A-I Regulatory Protein 1 COUP Transcription Factor 2 COUP-TFII ARP-1 Chicken Ovalbumin Upstream Promoter Transcription Factor 2 Chicken Ovalbumin Upstream Promoter-Transcription Factor I Nuclear Receptor Subfamily 2, Group F, Member 2 ADP-Ribosylation Factor Related Protein 1 Apolipoprotein AI Regulatory Protein 1 COUP-TF II COUPTFII COUP-TF2 CHTD4 SRXX5
Location (GRCh38)
15:96325797-96340263
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021005.4
Sequence length
5287.0 nt
GC content
0.4980

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1725.01 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1827.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1323.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145155.2 NCBI
UAAAGUUAGUGUGCAGGGUUUUCCAAGGCUGAGAGAGCCUAAUACAUGG… 3746 nt 0.4111
NM_001145156.1 NCBI
CUCCUUCCCUCGUCCUGGGUCCCGGGGUCCUGGGUACGUUUGGCUAGCC… 3501 nt 0.4130
NM_001145157.2 NCBI
AGAAUGCUACAUCCCGCCCACAGCGCCGGGGACCCCGAGGCAAGGUGGC… 3532 nt 0.4168
NM_021005.4 NCBI
GAGAAGCCACUUCUGCCAGCCCCGGCGCCUAUAAAUCGCAUUCCCUCCC… 5287 nt 0.4980
Summary

This gene encodes a member of the steroid thyroid hormone superfamily of nuclear receptors. The encoded protein is a ligand inducible transcription factor that is involved in the regulation of many different genes. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2010] CIViC Summary for NR2F2 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the NR2F2 is a specific marker for venous endothelial cells within the heterogeneous cellular atlas of interscapular brown adipose tissue, as identified through single-nucleus mRNA-sequencing [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252]. A study in zebrafish and mouse demonstrated that the NR2F2 transcript, a development gene and eye development transcription factor, increased in relative abundance within 0.5 hours postmortem in mouse [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].