Basic Information

Symbol
NR4A2
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Subfamily 4 Group A Member 2 TINUR NOT HZF-3 NURR1 RNR1 Transcriptionally-Inducible Nuclear Receptor Immediate-Early Response Protein NOT Orphan Nuclear Receptor NURR1 Transcriptionally Inducible Nuclear Receptor Related 1 NGFI-B/Nur77 Beta-Type Transcription Factor Homolog Nuclear Receptor Subfamily 4, Group A, Member 2 Nur Related Protein-1, Human Homolog Of Intermediate-Early Receptor Protein Orphan Nuclear Receptor NR4A2 T-Cell Nuclear Receptor NOT Nuclear Receptor Related 1 IDLDP
Location (GRCh38)
2:156324432-156342348
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006186.4
Sequence length
3472.0 nt
GC content
0.4793

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1034.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1095.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 811.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((...(((.(((((((....(((.(((.((((......))))))).)))...((.(((((..((((.(......).))))..))))))).((((((((...((((...(((..(.(((.(.((((.(((..(((((..(((((((((((.((((....((.(((((...))))).))....))))...))......)).)))))))......)))))...))).)))).).))))..))).))))...))))))))(((.....))).(((((.........(((((((((...(((((....((((((((((......(((((((((...(((((.((....((((((..(((..(((..((((((((........(((.(((((((((.((((.......)))).))).....((((....)))).................((((((((.((((................(((.((((((....(((((..(((......)))...)))))......((((...(((((((.((((.((((..((((((.(((((........(((..(((......(((((((......))))).)).....)))..)))..((((....))))))))).))))))))))....((((((............((......))..............))))))((((.((......))))))(((..(((((.....)))))..))).(((((((((((...((((...((((...(((((((.((((.(((...(((.((.((..(((.(...((((((((....((((.........)))).(((..(((((((((..(((.(((((.....((.........)).....))))).)))..))).......(((((..((((((...(((((.(((.((.(((((((..(((((((((((((((.((((((((((.....((.(((....)))..))....))))).))))).))))......((.(((........)))..))(((((((......)))))))...)))))))....))))...)))))))..)).))).)))))...))))))......((....)))))))..((((((....)))))).))))))..)))))))))))...).)))..)))).)))....)))))))))))))).((((.((....)).)))).((((((((((..((((......))))......))))))))))............)))).))))....))))))..((((((((.((....)).).)))))))((((.(((.(((.((((((((((((((.....(.(((((((.............((((..(((((((((.(.((..(((.........)))..)).).))..))))))).)))).(((...((((((((.(((..(.(((((....))))).)..))))))))..))).))).......((((((((....))))))))....))))))))))))))))......(((.......)))))))))...)))))).))))(((((((((((........)).)))))))))..))))))))).))))))).....))))...)))))))))((((((((((((((.((((((.(((..(((......)))..)))..((((.(((....))).))))..((((.(((.(((((((((((((......)))))))))..)))).))).))))..))))))....)).)))...))))))))).((((((.....)))))))))).)))))))).......((((((.(((........)))))))))............)))))))))))).)))))..))).)))..)))))))).)))))....)))).))))).....(((((.......)))))....((((...))))..)))))..)))))...((((((((...))).)))))....((((((.....((((((((..((..((((..(((((((.((((((....)))))).)))....((.((((.....)))).))))))..)))).))..)).))))))......))))))........))))).......))))))))).........)))))..........(((.((((((((((((((((((.(((((((((((.((......((((((((((.((.((.(((((.......))))).)).)).....)))))))...)))..)).))))))))(((...(((((((((.....(((((..(((((.(((((((..........(((.((((.....))))..)))((((((((..((((((....))))))(((((....(((((.(((...(((.(((.((((((((((((((.((((((...((......(((..(((.(((....))).))).)))......))...)))))).(((((((.(.(((.........)))).)))))))....(((((((.....(((((((.((((...........((((.(((((((((..(((.((((((((((.(((........))).))))...((((((((.......))))))))(((((((.((((...)))).)))))))))))))((((((((.((((((((((..(((((.(((...........)))))))).)))))))...))).))))))))((((((....))))))........)))..)))))..)))).)))).............................(.(((((((.((((((.(((......))).(((.((((((((.(((((.....))))))))))))).))).......((.((.((((((((((((.((((((((((((((.....(((..(((((.((.((.(((((...((((((......).)))))...))))).)).)))))))..)))..))))).))))).....)))))))))))))))).)).))....))))))..))))))).)..))))))))))).....)).)))))......))))))))))))))))))))....))).)))))...))))))))))..)))..))))))).)))))..))))).(((((((((((.......((........))........)))))))))))..))))))))).))).....))).)))))..)))))))))..)))).)))..............(((((((((..(.(((((..........))))).).)))))))))..((((....)))).))))))).)))...))))........((((((((...........))))))))....(((((((...)))))))..........(((((((...........)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((({...{{{.(((((((....(((,(((.((((......))))))),))}.{.((.(((((..((((,.......),)}))..))))))),((((((((...(((({(((,{..(.(((.{.((((.(((..(((((,.(((((((,({..((((....((.(((((...))))).))....))))...,|......)).)))))))...}..}))))...))).)))).}.))))..,)))))))...)))))))),{((({({|{{{((,.{{((({{.....|}|)}}|...(({{.....,{{{{,,{{|},,,,,(((((((({...(((((.((....((((((..(((..(((..(((((({{..,....|(((,({{(({{((.((((.,.....}))).))},,...{{{{....))))..,{{,....,,,....((((((((.((((...,,...........(((,((((((.,{,{,,,{{.{{(,..,,.}}}...,})),.,}..,{{{{...(((((((.(((((((((..((((((.(((((........(,(..(((......{{(((((......))))).}}.....))).,)))..((((....))))))))).)))))){{{....}}}.,.{{{..........||}...{{{,...}}}.....{{{{((,,((((({(,{{{{,({{{{|,((((((((.(((({{,{((..,||..{{,..((((((...((((...((((...(((((((.((((.(((...{((,((.{(..(((.(...((((((((....((((.........)))).(((..(((((({({..(((.(((((.....((.........)).....))))).)))..}},.......(((({..((((((...(((((.(((.((.(((((((,,((,,(((((((((((.((((((((((.....({.(((....)))..)}....))))).))))).))))......{{.{{{,.......}}}..}}{((((({......}))))))...)))))))..},,,)),..}))))))..)).))).)))))...)))))).....,((....)))))))..((((((....)))))).))))))..)))))))))))...).)))..)})).}))....)))))))))))))).((((.((....)).)))).{(((((((((..((((......))))......)))))))))}............)))).))))....))))))..))|...)))}}.))))..)))))))}},|||)))},{||,((((((((((((({....,(.(((((((.,...........((((..(((((((,(.(,{({.((({....}},.),)}..,,},),,.))))))).)))).(((...((((((((.(({,,{.(((((....))))).}.,))))))))..))).))).......{(((((((....))))))))....))))))))))))))))......(((,......}})}))}))...)))))}.,,,,||,||||||||}}}}}...,,.|||},,,,)},))))))))).))))))).....}))}||.}}}}}}}))(((((((((({{{,.((((((((..(((((.,{({.||{...}},..}||.},..}))))..)))}..,|||}|{,.(((((((((((((......)))))))))..)))).)))|)|||{{,}}}})}}},,|,},,.,}))))))))).((((((.....)))))))))).)))))))}.......((((((.(((........)))))))))......,,,,..}}})))}}}))).)))))..))).)))..)))))))).)))))....}))).))))),,...{{{{{.......})))}....((({...))))..,}||}..,}}},}}}||||||||,..,}).))|||,,..,{{{{{.,...{||||||(..({,{{,{|..||||(((,((((((....)))))).))).,,,{{.{{((..,,.}}},.)))))),,}}}),))..}),))))},.,,,{{|||||,.,,,...||||||......,,|||||||...{,,,....,,...,,...}))},||}|||{{{{{{{{{{{{{|{|{{,((((((((.((......((((((((((.((.((.(((((.......))))).)).)).....))))))),..}},..)).)))))))),,,...{{{{{{{{,.....{((((..(((((.(((((((..........(((.((((.....))))..)))(({{{{((|,((((((....)))))),{{{(....(((((.{((,,.{{{,(({.((((((((((((((.{(((((...|{......{((.,{{{.{((....}}}.}}}.))}......},...)))))}.{{{{{{({{,{{{.,,},,{{,|||,.}}}}}},..}}||||{{{,,,..(((((((.(({{..,,,......((((.(((({((((..{{{.((((((((((.(((........))).))))...((((((((.......))))))))(((((((.((((...)))).)))))))))))))((((((((,({((((((,({{(.(({{({{........,,,,)),,)))},))))))...)}}.})))))))((((({....}))))}.......,}))..))))}..)))).)))).............................{,(((((((.((((((.{{{...,..}},.(((.((((((((.(((((.....))))))))))))).})).......{{.,,.((((((((((((.((((((((((((((.....(((.,(((({,{(.((.(((((...((((((......).)))))...))))).)).)}))))).,)))..))))),})))),....}))))))))))))))).,}.}}....))))))..)))))))})..)))))))))))...}}}}.)))}},,....})))))))))))))})),,},}}.))).)))))...))))}}}}},..}))..))))))).)))))..))))).(((((((((((.......({........))........)))))))))))..,}}}})))},))),,,,,)))}))))),.}}}}||||||.}}}},))),,,,,,........(((((((((..{.{((((........,.))))}.,.)))))))))..{{{{..,.)))}.))))))).}}}.,.)))).,....,,((((((((...........))))))))....(((((((...)))))))...,,,...{((({{,,....,,,,.,})},}})},..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006186.4 NCBI
AAGCCACAUAAACAAAGGCACAUUGGCGGCCAGGGCCAGUCCGCCCGGC… 3472 nt 0.4793
NM_173173.3 NCBI
AAGCCACAUAAACAAAGGCACAUUGGCGGCCAGGGCCAGUCCGCCCGGC… 3294 nt 0.4766
Summary

This gene encodes a member of the steroid-thyroid hormone-retinoid receptor superfamily. The encoded protein may act as a transcription factor. Mutations in this gene have been associated with disorders related to dopaminergic dysfunction, including Parkinson disease, schizophernia, and manic depression. Misregulation of this gene may be associated with rheumatoid arthritis. Alternatively spliced transcript variants have been described, but their biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans and rats demonstrated that the NR4A2 is a significant diagnostic biomarker for myocardial infarction [Wei et al. DOI:10.3389/fimmu.2022.1061800]. A study in humans identified the NR4A2 as a "seed" gene in a protein-protein interaction network cluster associated with depressed suicide, derived from a co-expression module in the dorsolateral prefrontal cortex where gene expression progressively decreased from controls to MDD non-suicides to MDD suicides [Zeng et al. DOI:10.1016/j.psychres.2020.113513].