Basic Information

Symbol
NRCAM
RNA class
mRNA
Alias
Neuronal Cell Adhesion Molecule NgCAM-Related Cell Adhesion Molecule KIAA0343 Neuronal Surface Protein Bravo Bravo Ng-CAM-Related NEDNMS Nr-CAM HBravo
Location (GRCh38)
7:108147623-108456717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001037132.4
Sequence length
6701.0 nt
GC content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1859.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1991.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1820.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371127.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6419 nt 0.4200
NM_001371128.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6540 nt 0.4231
NM_001371129.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6341 nt 0.4204
NM_001371130.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6417 nt 0.4201
NM_001371131.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6782 nt 0.4216
NM_001371132.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6459 nt 0.4234
NM_001371133.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6602 nt 0.4187
NM_001371134.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6335 nt 0.4191
NM_001371135.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6374 nt 0.4206
NM_001371136.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6464 nt 0.4197
Showing 11 to 20 of 67 entries
Summary

Cell adhesion molecules (CAMs) are members of the immunoglobulin superfamily. This gene encodes a neuronal cell adhesion molecule with multiple immunoglobulin-like C2-type domains and fibronectin type-III domains. This ankyrin-binding protein is involved in neuron-neuron adhesion and promotes directional signaling during axonal cone growth. This gene is also expressed in non-neural tissues and may play a general role in cell-cell communication via signaling from its intracellular domain to the actin cytoskeleton during directional cell migration. Allelic variants of this gene have been associated with autism and addiction vulnerability. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the mRNA biomarker NRCAM is down-regulated with increasing age in peripheral blood, showing the highest validation correlation (R²=0.46) among mRNA markers in independent TaqMan qPCR analysis [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014].