Basic Information

Symbol
NRCAM
RNA class
mRNA
Alias
Neuronal Cell Adhesion Molecule NgCAM-Related Cell Adhesion Molecule KIAA0343 Neuronal Surface Protein Bravo Bravo Ng-CAM-Related NEDNMS Nr-CAM HBravo
Location (GRCh38)
7:108147623-108456717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001037132.4
Sequence length
6701.0 nt
GC content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1859.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1991.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1820.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371137.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6169 nt 0.4198
NM_001371138.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6539 nt 0.4206
NM_001371139.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6519 nt 0.4232
NM_001371140.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6455 nt 0.4206
NM_001371141.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6389 nt 0.4207
NM_001371142.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6330 nt 0.4201
NM_001371143.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6432 nt 0.4220
NM_001371144.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6686 nt 0.4195
NM_001371145.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6491 nt 0.4210
NM_001371146.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6608 nt 0.4215
Showing 21 to 30 of 67 entries
Summary

Cell adhesion molecules (CAMs) are members of the immunoglobulin superfamily. This gene encodes a neuronal cell adhesion molecule with multiple immunoglobulin-like C2-type domains and fibronectin type-III domains. This ankyrin-binding protein is involved in neuron-neuron adhesion and promotes directional signaling during axonal cone growth. This gene is also expressed in non-neural tissues and may play a general role in cell-cell communication via signaling from its intracellular domain to the actin cytoskeleton during directional cell migration. Allelic variants of this gene have been associated with autism and addiction vulnerability. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the mRNA biomarker NRCAM is down-regulated with increasing age in peripheral blood, showing the highest validation correlation (R²=0.46) among mRNA markers in independent TaqMan qPCR analysis [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014].