Basic Information

Symbol
NRCAM
RNA class
mRNA
Alias
Neuronal Cell Adhesion Molecule NgCAM-Related Cell Adhesion Molecule KIAA0343 Neuronal Surface Protein Bravo Bravo Ng-CAM-Related NEDNMS Nr-CAM HBravo
Location (GRCh38)
7:108147623-108456717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001037132.4
Sequence length
6701.0 nt
GC content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1859.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1991.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1820.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371157.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6397 nt 0.4185
NM_001371158.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6518 nt 0.4214
NM_001371159.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6365 nt 0.4190
NM_001371160.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6380 nt 0.4199
NM_001371161.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6386 nt 0.4197
NM_001371162.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6483 nt 0.4228
NM_001371163.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6783 nt 0.4225
NM_001371164.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6414 nt 0.4222
NM_001371165.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6534 nt 0.4230
NM_001371166.1 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6270 nt 0.4246
Showing 41 to 50 of 67 entries
Summary

Cell adhesion molecules (CAMs) are members of the immunoglobulin superfamily. This gene encodes a neuronal cell adhesion molecule with multiple immunoglobulin-like C2-type domains and fibronectin type-III domains. This ankyrin-binding protein is involved in neuron-neuron adhesion and promotes directional signaling during axonal cone growth. This gene is also expressed in non-neural tissues and may play a general role in cell-cell communication via signaling from its intracellular domain to the actin cytoskeleton during directional cell migration. Allelic variants of this gene have been associated with autism and addiction vulnerability. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the mRNA biomarker NRCAM is down-regulated with increasing age in peripheral blood, showing the highest validation correlation (R²=0.46) among mRNA markers in independent TaqMan qPCR analysis [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014].