Basic Information

Symbol
NRCAM
RNA class
mRNA
Alias
Neuronal Cell Adhesion Molecule NgCAM-Related Cell Adhesion Molecule KIAA0343 Neuronal Surface Protein Bravo Bravo Ng-CAM-Related NEDNMS Nr-CAM HBravo
Location (GRCh38)
7:108147623-108456717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001037132.4
Sequence length
6701.0 nt
GC content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1859.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1991.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1820.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001371177.1 NCBI
GCCAGUGCUUUUAUCUGCAGAAAUGUGCUGGGAUGGGCACUUUGUUUAA… 6119 nt 0.4094
NM_001371178.1 NCBI
GCCAGUGCUUUUAUCUGCAGAAAUGUGCUGGGAUGGGCACUUUGUUUAA… 6092 nt 0.4079
NM_001371179.1 NCBI
GCCAGUGCUUUUAUCUGCAGAAAUGUGCUGGGAUGGGCACUUUGUUUAA… 6381 nt 0.4115
NM_001371180.1 NCBI
GCCAGUGCUUUUAUCUGCAGAAAUGUGCUGGGAUGGGCACUUUGUUUAA… 5880 nt 0.4075
NM_001371181.1 NCBI
GUGCAGAGUACAUUACUCUCAUCGAGAGAAAUCUCAGUCUUCUGUAGCU… 6285 nt 0.4118
NM_001371182.1 NCBI
GUGCAGAGUACAUUACUCUCAUCGAGAGAAAUCUCAGUCUUCUGUAGCU… 6210 nt 0.4108
NM_005010.5 NCBI
AGCCUCGCUUCGCCAGGGUCGCUGGCGGACGCGCGCCGCAGUCCGAGCC… 6338 nt 0.4192
Showing 61 to 67 of 67 entries
Summary

Cell adhesion molecules (CAMs) are members of the immunoglobulin superfamily. This gene encodes a neuronal cell adhesion molecule with multiple immunoglobulin-like C2-type domains and fibronectin type-III domains. This ankyrin-binding protein is involved in neuron-neuron adhesion and promotes directional signaling during axonal cone growth. This gene is also expressed in non-neural tissues and may play a general role in cell-cell communication via signaling from its intracellular domain to the actin cytoskeleton during directional cell migration. Allelic variants of this gene have been associated with autism and addiction vulnerability. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the mRNA biomarker NRCAM is down-regulated with increasing age in peripheral blood, showing the highest validation correlation (R²=0.46) among mRNA markers in independent TaqMan qPCR analysis [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014].