Basic Information

Symbol
NRF1
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Respiratory Factor 1 Alpha Palindromic-Binding Protein ALPHA-PAL EWG Alpha-Pal NRF-1
Location (GRCh38)
7:129611699-129757082
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005011.5
Sequence length
3518.0 nt
GC content
0.4955

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1235.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1303.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 748.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040110.2 NCBI
CCCCUUUCAGUUCCUGGUCCAGAACUUUACACAGAAAAGGUGCUCAAAG… 3517 nt 0.4851
NM_001293163.2 NCBI
AGAAGCGGCAGCGCUCGCCAUUGCCGCUGGUGGCAGGAGGCUGCGAGGA… 3578 nt 0.4961
NM_001293164.2 NCBI
AGAAGCGGCAGCGCUCGCCAUUGCCGCUGGUGGCAGGAGGCUGCGAGGA… 3406 nt 0.4947
NM_005011.5 NCBI
AGAAGCGGCAGCGCUCGCCAUUGCCGCUGGUGGCAGGAGGCUGCGAGGA… 3518 nt 0.4955
Summary

This gene encodes a protein that homodimerizes and functions as a transcription factor which activates the expression of some key metabolic genes regulating cellular growth and nuclear genes required for respiration, heme biosynthesis, and mitochondrial DNA transcription and replication. The protein has also been associated with the regulation of neurite outgrowth. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Confusion has occurred in bibliographic databases due to the shared symbol of NRF1 for this gene and for "nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 1" which has an official symbol of NFE2L1. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that specific in vivo α-particle irradiation of Kupffer or endothelial liver cells induced an inflammatory state with characteristic gene expression changes [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078]. In human pediatric burn patients, skeletal muscle biopsies revealed altered expression of PPARs and associated mitochondrial genes, though the NRF1 was not directly measured in this experimental context [Tzika et al. DOI:10.3892/ijmm_00000244].