Basic Information

Symbol
NRIP1
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Interacting Protein 1 Nuclear Factor RIP140 RIP140 Nuclear Receptor-Interacting Protein 1 Receptor-Interacting Protein 140 Receptor Interacting Protein 140 CAKUT3
Location (GRCh38)
21:14961235-15065936
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003489.4
Sequence length
7751.0 nt
GC content
0.3879

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2044.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2197.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1890.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003489.4 NCBI
AGACAUUGCAGCAGAGCCCCGAACUCGGGAGGCGGCGGCGGAGGAGGCG… 7751 nt 0.3879
Summary

Nuclear receptor interacting protein 1 (NRIP1) is a nuclear protein that specifically interacts with the hormone-dependent activation domain AF2 of nuclear receptors. Also known as RIP140, this protein modulates transcriptional activity of the estrogen receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the NRIP1 mRNA, a transcriptional control factor, was up-regulated by 95% in pericontusional brain tissue from a patient with traumatic brain injury (patient T7) compared to control tissue, as identified via cDNA microarray analysis [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].