Basic Information

Symbol
NRN1
RNA class
mRNA
Alias
Neuritin 1 NRN Neuritin DJ380B8.2
Location (GRCh38)
6:5997999-6008688
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016588.3
Sequence length
1582.0 nt
GC content
0.4564

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-471.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -503.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278710.2 NCBI
AGAGCUCAGCUGCUGGGUUGGAGAAAAAGAGGGUCUGCGGUCGCAAAUG… 1472 nt 0.4552
NM_001278711.2 NCBI
CUCUUCGGCGUCUGGCCCGGCGCUCGCGGACAGGCGCCCGCGUUGGGGG… 1779 nt 0.5087
NM_016588.3 NCBI
CUCUUUCUGUCUCUUCCUCGCUCCCUCUCUUUCUCUCCUCCCUCUGCCU… 1582 nt 0.4564
Summary

This gene encodes a member of the neuritin family, and is expressed in postmitotic-differentiating neurons of the developmental nervous system and neuronal structures associated with plasticity in the adult. The expression of this gene can be induced by neural activity and neurotrophins. The encoded protein contains a consensus cleavage signal found in glycosylphoshatidylinositol (GPI)-anchored proteins. The encoded protein promotes neurite outgrowth and arborization, suggesting its role in promoting neuritogenesis. Overexpression of the encoded protein may be associated with astrocytoma progression. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A bioinformatic study in adult female Wistar rats (Rattus norvegicus) identified 68 time-course differentially expressed microRNAs after spinal cord injury, with synergetic analysis revealing 193 co-regulated target genes enriched in nervous system development and interaction networks identifying top hub genes like AKT1, VEGFA, and BDNF [Liu et al. DOI:10.1097/BRS.0000000000001323].